以色譜中心策略算法(CCS)提高基于質(zhì)譜的組學數(shù)據(jù)質(zhì)量
南科大醫(yī)學院教授張文勇、研究助理教授欒合密等在國際著名生物信息學與計算生物學期刊Bioinformatics上發(fā)表題為“CPVA: a web-based metabolomic tool for chromatographic peak visualization and annotation”的論文。該研究創(chuàng)新提出了以色譜中心策略算法(CCS)提高基于質(zhì)譜的組學數(shù)據(jù)質(zhì)量,并搭建了R-Shiny的Web應用CPVA,實現(xiàn)了組學數(shù)據(jù)在線交互式的處理。該論文提出了色譜中心策略算法(CCS),并開發(fā)了在線互動工具來解決該領(lǐng)域普遍存在的問題。色譜中心策略是指通過對組學數(shù)據(jù)中提取的色譜峰形狀進行數(shù)字化描述,包括對稱性(Symmetry)、鋸齒度(Jaggedness)、形態(tài)(Modality)、色譜質(zhì)量指數(shù)(MCQ)等,并以在線互動的方式直接展示色譜峰的形態(tài)特征。
南方科技大學
2021-04-11