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胃癌是常見的消化道惡性腫瘤。據(jù)2020年全球癌癥統(tǒng)計(jì)，胃癌的發(fā)病率和死亡率已分別居惡性腫瘤的第5位和第4位，給社會(huì)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。目前胃癌的治療包括外科手術(shù)結(jié)合放療、化療或靶向藥物治療。雖然患者的預(yù)后在逐漸改善，但結(jié)果仍不盡如人意。因此，深入探討影響胃癌治療和預(yù)后的因素，制定新的臨床治療策略是改善胃癌患者預(yù)后的首要任務(wù)。近年來，研究人員對(duì)腫瘤與TME之間的關(guān)系有了更深入的了解。研究發(fā)現(xiàn)，腫瘤細(xì)胞可以通過過度表達(dá)PD-L1蛋白和分泌白細(xì)胞介素抑制劑來誘導(dǎo)免疫逃逸。此外，腫瘤相關(guān)的成纖維細(xì)胞包圍腫瘤細(xì)胞，抑制免疫細(xì)胞浸潤(rùn)和藥物滲透，導(dǎo)致治療失敗。研究發(fā)現(xiàn)，TME細(xì)胞的富集水平可以用來評(píng)估胃癌的預(yù)后。因此，分析TME的異質(zhì)性，對(duì)于確定TME的定量指標(biāo)，指導(dǎo)胃癌的治療策略和預(yù)后評(píng)估，可能是提高療效和預(yù)后的關(guān)鍵。 組蛋白脫乙酰酶(HDACs)是一類共18種類型(HDCA1-11、SIRT1-7)的蛋白酶，研究表明，HDAC通過可逆地調(diào)節(jié)組蛋白和非組蛋白的乙酰化狀態(tài)，在TME的發(fā)展中起著關(guān)鍵作用。此外，研究發(fā)現(xiàn)，HDAC6參與了免疫系統(tǒng)中幾個(gè)關(guān)鍵因子的上調(diào)。然而，不同類型的HDAC在調(diào)節(jié)TME細(xì)胞浸潤(rùn)水平方面存在異質(zhì)性，單個(gè)分子或一類分子靶向抑制劑很難精確控制TME的變化。因此，迫切需要系統(tǒng)分析HDACs的表達(dá)譜和相應(yīng)的TME特征，為胃癌的臨床治療策略和預(yù)后評(píng)估提供理論依據(jù)。 本發(fā)明提供了利用多組學(xué)方法研究HDACs在胃癌中的作用。分析了胃癌細(xì)胞系/患者的RNA-SEQ數(shù)據(jù)，并研究了HDAC表達(dá)與TME中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的關(guān)系。通過本發(fā)明的研究確定了胃癌準(zhǔn)確預(yù)后的新靶點(diǎn)，有助于開發(fā)有效的治療策略。本發(fā)明篩選獲得與胃癌預(yù)后相關(guān)的103個(gè)基因，基于PCA方法構(gòu)建了HDS評(píng)分，分析結(jié)果證明：高HDS組比低HDS組胃癌患者有更長(zhǎng)的生存時(shí)間；高HDS的胃癌患者更適合使用免疫治療；II期低HDS胃癌患者比高HDS胃癌患者從術(shù)后化療中獲益更多。 本發(fā)明的HDS評(píng)價(jià)體系為預(yù)測(cè)胃癌預(yù)后、選擇術(shù)后輔助化療方案和免疫治療方案提供了一種新的方法，在臨床上具有良好的應(yīng)用前景。

提示在宿主—血吸蟲相互作用的過程中，不僅血吸蟲可以通過蟲源性細(xì)胞外囊泡對(duì)宿主進(jìn)行跨物種調(diào)控，達(dá)到逃逸宿主攻擊的目的；宿主亦可以通過自身細(xì)胞外囊泡抑制血吸蟲，緩解血吸蟲對(duì)自身的病理?yè)p傷，對(duì)于我們理解寄生蟲與宿主之間復(fù)雜的相互作用關(guān)系提供了新的線索，值得我們?cè)谖磥淼难芯恐袑?duì)其進(jìn)行進(jìn)一步的關(guān)注。提示在宿主—血吸蟲相互作用的過程中，不僅血吸蟲可以通過蟲源性細(xì)胞外囊泡對(duì)宿主進(jìn)行跨物種調(diào)控，達(dá)到逃逸宿主攻擊的目的；宿主亦可以通過自身細(xì)胞外囊泡抑制血吸蟲，緩解血吸蟲對(duì)自身的病理?yè)p傷，對(duì)于我們理解寄生蟲與宿主之間復(fù)雜的相互作用關(guān)系提供了新的線索，值得我們?cè)谖磥淼难芯恐袑?duì)其進(jìn)行進(jìn)一步的關(guān)注。

近日，我校生命科學(xué)學(xué)院李學(xué)寶教授課題組在棉纖維發(fā)育的分子機(jī)制研究方面取得重要進(jìn)展，研究成果在線發(fā)表于著名植物學(xué)期刊《The Plant Journal》（Li et al. 2018,DOI:10.1111/tpj.14108）。

本項(xiàng)目采用化學(xué)生物學(xué)手段，篩選出特異性成環(huán)標(biāo)記5-醛基胞嘧啶（5fC）的化合物——疊氮茚二酮和丙二腈，并且標(biāo)記產(chǎn)物在隨后的PCR擴(kuò)增過程實(shí)現(xiàn)胞嘧啶（C）到胸腺嘧啶（T）的轉(zhuǎn)變，可實(shí)現(xiàn)全基因組5-醛基胞嘧啶的單堿基分辨率檢測(cè)。用疊氮茚二酮標(biāo)記作為標(biāo)記化合物，可實(shí)現(xiàn)對(duì)含有5-醛基胞嘧啶DNA片段的先富集再測(cè)序，將測(cè)序成本大大降低。用生物相容性很好的丙二腈作為標(biāo)記化合物，可實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平的5-醛基胞嘧啶單堿基分辨率檢測(cè)。血液中細(xì)胞外游離DNA上的核酸修飾可以作為人類癌癥的生物標(biāo)記物，本項(xiàng)目涉及的核酸修飾檢測(cè)技術(shù)，不會(huì)造成DNA降解，適應(yīng)于臨床小量珍貴樣品，在癌癥的液態(tài)活檢上具有重大潛力。