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南京郵電大學理學院曾紅麗副教授與合作者在新型冠狀病毒SARS-CoV-2基因序列分析方面取得重要進展，預測了該病毒在自然選擇過程中的適應性，指出并分析了該病毒在演化過程中存在的弱點，分析了相應綜合醫藥開發應注意的關鍵基因位點。該成果以南京郵電大學為第一完成單位，于2020年11月17日在線發表于國際權威期刊美國國家科學院院刊（PNAS）上。 COVID-19疫情是由β-冠狀病毒SARS-CoV-2引起的全球性公共衛生突發事件。各類數據庫搜集了大量的且不斷增加的高質量全基因組序列。本工作利用這些序列，研究其是否顯示出病毒演化過程中上位性對適應性的影響。在具有高重組率的種群演化中，本工作創新性地發展和應用了統計物理學中的反Potts模型，來檢測自然選擇過程中的上位性影響。該工作為利用大量基因組序列來獲取具有高重組率的病原體在演化過程中的弱點開辟了廣闊前景。 該研究工作最終將新型冠狀病毒的大約3萬個基因位點濃縮為存在顯著相互影響的8對基因位點（ORF3a和nsp2，nsp12和nsp6，ORF8和nsp4，以及基因nsp2，nsp13和nsp14），為尋找病毒病原體結合和重組過程中存在的弱點帶來了希望，對開發臨床治療的綜合靶向藥物、研究病毒進入宿主后的發病機制有著很強的生物醫學指導意義。 和其他許多疾病一樣，針對COVID-19的潛在藥物靶標的組合數量非常多。本研究工作不僅提供了哪些基因位點之間存在相互影響，并可以對其進行排名，從而進行更進一步詳細研究。結合隨機性檢驗，該研究工作最終預測了存在顯著上位性的8對基因位點中，有3對涉及到與新冠肺炎的重癥密切相關的病毒基因ORF3a。遺憾的是，目前關于針對ORF3a基因的臨床靶向藥物的報道還較為罕見，值得醫藥學研究人員在該方面加強研究。另外，本研究工作中預測的8對基因位點可作為實驗生物學的原假設，以供生物學研究人員在此基礎上設置相關微生物實驗，研究新冠病毒進入人體后引起發病的機理。 此項研究工作由南京郵電大學與意大利的里雅斯特大學、古巴哈瓦那大學、瑞典哥德堡大學及瑞典皇家理工大學合作完成。曾紅麗副教授的研究工作受到國家自然科學基金委（基金號11705097）、江蘇省科學技術廳（基金號BK20170895）以及江蘇省政府留學獎學金的大力支持。

本發明涉及基因工程技術領域，特別涉及甘藍型油菜及其親本物種白菜和甘藍TT2基因家族及其應用； 所述白菜透明種皮2的基因家族包括2個成員：BrTT2-l基因和BrTT2-2基因，所述甘藍TT2的基因家族的 1個成員BoTT2基因，所述甘藍型油菜TT2基因家族包括3個成員：BnTT2-l基因、BnTT2-2基因和BnTT2- 3基因；蕓菱屬6個TT2基因之間具有很高的同源性；本發明還公開了上述基因家族在植物分子育種中的應 用,通過反義抑制其在黑籽甘藍型油菜中的表達后,轉基因植株發生了種皮顏色變淺等性狀變化，具有創造 轉基因黃籽材料的潛力。

本發明涉及基因工程技術領域，特別涉及甘藍型油菜及其親本物種白菜和甘藍MYBL2基因家族及其應 用；所述白菜MYBL2基因家族包括2個成員：BrMYBL2-l基因和BrMYBL2-2基因，所述甘藍MYBL2基因家 族包括2個成員：B0MYBL2-1基因和BoMYBL2-2基因，所述甘藍型油菜MYBL2基因家族包括4個成員： BnMYBL2-l基因、BnMYBL2-2基因、BnMYBL2-3基因和BnMYBL2-4基因；蕓臺屬8個MYBL2基因之間具 有較高的同源性；本發明還公開了上述基因家族在植物分子育種中的應用，通過構建正義超量表達植物載體，轉化黑籽甘藍型油菜品種中雙10號后，獲得6株轉基因植株。與非轉基因的外植體對照相比，轉基因植 株生長發育正常，但種皮中原花青素等色素減少，同時種皮變薄，形成轉基因黃籽性狀，是油菜黃籽性狀育 種的新資源。

 三疣梭子蟹基因組圖譜     唐伯平供圖蝦蟹類基因組是公認的高復雜基因組，要獲得高質量的基因組有著很多困難。近日，由鹽城師范學院江蘇省鹽土生物資源研究重點實驗室教授唐伯平課題組牽頭的中外合作團隊，第一次獲得了我國重要淡水和海水經濟蟹類中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的高質量基因組圖譜，并分別在線發表于GigaScience和《遺傳學前沿》。三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）是我國沿海大型的海洋經濟蟹類，我國每年捕撈量在55萬噸左右。唐伯平團隊獲得的三疣梭子蟹基因組大小為1.00Gb，片段重疊群N50的長度為 4.12Mb，被注釋到16796個蛋白編碼基因，其基因組的完整性為94.7%，整個基因組的重復序列是54.52%。科研人員鑒定出三疣梭子蟹染色體為50對，裝配率為97.80%，Hi-C的N50為21.79Mb。這是一個高質量、相當完整的染色體水平基因組，也是蟹類研究中第一次通過分子生物學的方法精確地對蟹類染色體數目進行鑒定。 三疣梭子蟹    唐伯平供圖中華絨螯蟹（Eriocheir japonica sinensis）俗稱河蟹，是世界上最重要的淡水經濟蟹類，目前我國每年河蟹產量為80萬噸左右。研究人員獲得的中華絨螯蟹基因組大小為1.27Gb，Contig序列N50為3.19Mb，且其GC含量為43%，高于其他節肢動物。BUSCO評估其完整性為94.00%，重復序列在基因組中占61.42%，被功能注釋蛋白編碼基因22619個。 中華絨螯蟹   唐伯平供圖唐伯平團隊對甲殼動物中華絨螯蟹、三疣梭子蟹、凡納濱對蝦，昆蟲埃及伊蚊、黑腹果蠅、偏瞳蔽眼蝶、蜘蛛等7種節肢動物基因家系展開進一步研究發現，它們共有15503個基因家系，其中8832個基因家系為共有家系，328個和544個基因家系分別唯一存在于三疣梭子蟹和中華絨螯蟹中。在這7種節肢動物中，蝦蟹相對進化速率最小，其中對蝦進化速度最慢，其次是絨螯蟹和梭子蟹。“相對于昆蟲，蝦蟹類進化較慢，可能是它們生活的環境相對于昆蟲更加穩定。”唐伯平說。 蝦蟹系統演化關系和相對進化速率圖     唐伯平供圖另一個有趣的發現是，蝦蟹與昆蟲的分化以及螃蟹和對蝦的分化幾乎是同時發生在4.3億年左右的志留紀。同屬于短尾類的中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的分化時間則相對較晚，大約是在1.8億年前的侏羅紀。我國同時獲得1種海洋和1種淡水重要經濟蟹類高質量的基因組圖譜，將為蟹類和甲殼動物的研究提供重要的理論基礎和數據支撐，同時也為經濟蟹類育種、養殖和疾病防控工作提供重要的基礎平臺。相關論文信息：https://doi.org/10.1093/gigascience/giz161https://doi.org/10.3389/fgene.2019.01340

研發階段/n該發明涉及人工構建的偽狂犬病毒（pseudorabiesvirus，PrV）和豬細小病毒（porcineparvovirus，PPV）的主要結構基因VP2。在缺失了主要毒力基因（TK）和病毒增殖非必需基因（gG）的偽狂犬病毒基因組中，定位插入豬細小病毒的VP2基因，使其位于偽狂犬病毒的強晚期啟動子下游，插入的外源基因編碼的蛋白具有良好的免疫原性，可以刺激豬產生抵抗豬細小病毒和豬偽狂犬病毒兩種強毒攻擊的保護性免疫反應。該發明還包括重組的偽狂犬病毒Pseudorabiesvirus，Hzau

研發階段/n可用于豬胴體性狀的遺傳改良，在豬的遺傳改良中胴體性狀的測定需要進行屠宰測定，只有背膘厚度性狀可在達到目標體重時進行活體測定，利用這3項專利，可以進行胴體性狀的改良（不需要進行屠宰測定），降低背膘厚度，降低板油率和內脂率，提高瘦肉率和腿臀肉骨率。

利用四通道連續噴墨打印機，結合鈣鈦礦成膜特性和原理，開發了一種適用于混合鈣鈦礦薄膜制備的高通量連續噴墨打印技術。四種前驅體對應四通道噴頭，每種噴頭可以打印一種成分，在同一玻璃基底上依次打印，通過控制每個噴頭的打印點進而形成不同組分鈣鈦礦薄膜。整個打印過程可以通過系統軟件控制，實現全自動混合打印。打印的薄膜成品質量高，能夠進行物相、光學吸收和熒光強度

中試階段/n該項目所用的材料是牛皰疹病毒1型BHV-1臨床分離株，具有全部的毒力因子和其他免疫原性很好的抗原。因此，以該病毒為基礎構建的牛傳染性鼻氣管炎ΔTK/ΔgE基因缺失標志菌株所制備的基因工程疫苗對牛免疫具有很強的針對性，具有廣闊的市場應用前景。

可以量產/n該研究通過定向基因缺失技術將牛傳染性鼻氣管炎病毒的毒力基因TK和必需基因gG缺失，得到了牛傳染性鼻氣管炎的gG和TK雙基因缺失突變株。疫苗免疫是防制牛傳染性鼻氣管炎的根本措施，滅活疫苗不能區分野毒感染和疫苗免疫牛，弱毒疫苗有殘余毒力和返強風險，該研究獲得的牛傳染性鼻氣管炎的gG和TK雙基因缺失突變株，可區分野毒感染牛和疫苗免疫牛，是血清學“標志”疫苗，為我國牛傳染性鼻氣管炎根除計劃提供了技術支撐。先進性及主要技術指標：（一）先進性該研究是由我國自主研發，具有完全知識產權的牛

可以量產/n華雜棉4號是以陸地棉B0011品系為母本，轉Bt抗蟲基因陸地棉118-1品系為父本，進行人工去雄雜交配制的雜種一代優勢組合。2009年通過江西省審定，同時獲得農業轉基因生物生產應用安全證書。產量表現：2006-2007年參加江西省棉花區域試驗，平均畝產122.3kg/666.7m2。纖維品質（HVICC標準）：平均長度29.2mm，整齊度84.8%，比強度30.5cN/tex，伸長率為6.8%，馬克隆值為5.0，反射率為73.1%，黃度為8.6，紡紗均勻性指數為140.3。枯萎病相對抗指