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斷奶前仔豬腹瀉是養(yǎng)豬生產(chǎn)中的常見疾病，給世界養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失，腸毒素大腸桿菌（ETEC）F4ac是引發(fā)斷奶前仔豬腹瀉的最主要致病菌。本項(xiàng)目在國(guó)家863、國(guó)家科技支撐計(jì)劃、江西省科技創(chuàng)新重大專項(xiàng)等項(xiàng)目支持下，通過(guò)6年多的研發(fā)，在國(guó)際上首次確定了MUC13為決定斷奶前仔豬腹瀉易感性的ETEC F4ac受體基因。發(fā)現(xiàn)了對(duì)ETEC F4ac易感和抗性個(gè)體鑒別準(zhǔn)確率大于97%的關(guān)鍵突變位點(diǎn)。由此首次在國(guó)際上發(fā)明了高精準(zhǔn)度的、具有完全自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)且廣泛適用于杜洛克、長(zhǎng)白和大白三個(gè)主要商業(yè)豬種的斷奶前仔豬腹瀉抗病育種新技術(shù)。本項(xiàng)目在動(dòng)物遺傳育種領(lǐng)域有影響的國(guó)際性學(xué)術(shù)期刊發(fā)表本發(fā)明技術(shù)直接相關(guān)的SCI論文10篇，其中1篇為國(guó)際專業(yè)雜志封面文章。獲國(guó)家授權(quán)發(fā)明專利2項(xiàng)。培養(yǎng)博士3人，碩士15人，1篇博士論文獲全國(guó)優(yōu)秀百篇博士論文提名獎(jiǎng)。 2008年以來(lái)，通過(guò)國(guó)家生豬現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系平臺(tái)，進(jìn)行了大面積的專利技術(shù)推廣應(yīng)用，結(jié)合常規(guī)育種，系統(tǒng)地在我國(guó)20個(gè)生豬主產(chǎn)?。ㄊ校?5家國(guó)家級(jí)重點(diǎn)種豬場(chǎng)的84個(gè)核心育種群（14396個(gè)體）中開展了抗F4ac仔豬腹瀉病的專門化新品系選育。經(jīng)過(guò)3年的選育改良，使受試種群中的杜洛克、大白、長(zhǎng)白易感個(gè)體的比例分別下降20%，25.1%和25.4%，顯著提高了這些核心育種群的斷奶前仔豬腹瀉抗性。 本項(xiàng)目實(shí)現(xiàn)了我國(guó)種豬抗病育種技術(shù)的重大自主創(chuàng)新，有力地推動(dòng)了我國(guó)種豬業(yè)的行業(yè)科技進(jìn)步和健康可持續(xù)發(fā)展。

2020年1月30日，天津大學(xué)生物信息中心新型冠狀病毒基因組注釋數(shù)據(jù)庫(kù)上線，并納入中國(guó)國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心向全球開放服務(wù)。天津大學(xué)生物信息中心的高峰教授、羅昊博士采用已研發(fā)的ZCURVE_CoV系列軟件對(duì)包括新型冠狀病毒(2019-nCoV)在內(nèi)的兩千余株冠狀病毒的基因組進(jìn)行了基因識(shí)別和酶切位點(diǎn)預(yù)測(cè)，并以數(shù)據(jù)庫(kù)(ZCURVE_CoV Database)的形式提供網(wǎng)上服務(wù)。

本發(fā)明公開了一種植物株系相關(guān)蛋白PROG2及其編碼基因與應(yīng)用。本發(fā)明所提供的植物株系相關(guān)蛋白PROG2為如下a1)或a2)或a3)：a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)；a2)在序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)的N端和/或C端連接標(biāo)簽得到的融合蛋白質(zhì)；a3)將a1)或a2)所示的蛋白質(zhì)經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加得到的與植物株型相關(guān)的蛋白質(zhì)。實(shí)驗(yàn)證明，植物株系相關(guān)蛋白PROG2對(duì)調(diào)控水稻株型和產(chǎn)量具有非常重要的作用，在培育高產(chǎn)水稻新品種中具有廣闊前景。

各種病毒性疫病在世界各地 不斷爆發(fā)，造成了慘重的損失， 并對(duì)人類健康造成了嚴(yán)重威脅。 由于病毒的快速變異，一般的疫 苗會(huì)喪失保護(hù)作用。

山東大學(xué)高等醫(yī)學(xué)研究院王培會(huì)課題組目前擁有SARS和COVID-19編碼的所有基因。為了減少科研人員重復(fù)工作和科研經(jīng)費(fèi)浪費(fèi)，現(xiàn)無(wú)償為學(xué)術(shù)界提供pcDNA6B-viral gene-FLAG載體。另外，對(duì)于擅長(zhǎng)PCR和分子克隆的實(shí)驗(yàn)室，也可以自行合成（最快只需3-7天）。如果并不擅長(zhǎng)PCR和分子克隆，推薦等待郵寄方式（聯(lián)系方式[email protected]）。 

阿特拉津是常用除草劑，也是內(nèi)分泌干擾劑，降解阿特拉津的酶為阿特拉津氯水解酶，全世界報(bào)道其基因僅兩家單位，美國(guó)一家，中國(guó)南開大學(xué)一家。轉(zhuǎn)阿特拉津氯水解酶基因有三點(diǎn)主要應(yīng)用價(jià)值：轉(zhuǎn)基因作物在阿特拉津噴施的田地中能正常生長(zhǎng)、提高制種純度（如雜交水稻）、修復(fù)阿特拉津環(huán)境污染。

（ i ）能夠阻礙 DNA 聚合酶在反轉(zhuǎn)錄過(guò)程的單堿基延伸；（ ii ）能夠降低缺口連接酶的連接效率。 SELECT 方法采用熒光定量 PCR 的方法進(jìn)行定量。結(jié)合方法優(yōu)化，發(fā)展了 SELECT 方法的 3 個(gè)應(yīng)用實(shí)例：（ i ）在生物學(xué)樣本總 RNA 或總 mRNA 中檢測(cè) mRNA 或 lncRNA 上單位點(diǎn)是否含有 m6A 修飾；（ ii ）檢測(cè)生物學(xué)樣本中特定 m6A 位點(diǎn)的修飾比例；（ iii ）鑒定 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶或去甲基酶的生理作用靶點(diǎn)。 SELECT 方法不僅簡(jiǎn)化了生物學(xué)樣品中 m6A 修飾的檢測(cè)過(guò)程，實(shí)現(xiàn)低豐度 RNA 中 m6A 單堿基分辨率的檢測(cè)，還能夠應(yīng)用于其他 RNA 化學(xué)修飾的檢測(cè)中，例如 N1- 甲基腺嘌呤（ N1-methyladenosine ， m1A ）和 2’-O- 甲基化修飾（ 2’-O-methylation ， Nm) 等。

本發(fā)明公開了一種檢測(cè)十種主要柑桔病害病原的基因芯片，包括固相載體和固定在該固相載體上的特異 性寡核苷酸探針，其特征在于：固定在所述固相載體上的特異性寡核苷酸探針具有SEQIDNO:1-SEQIDNOIO所示的寡核苷酸序列或者與SEQIDNO:1-SEQIDNO:10^示的寡核苷酸序列互補(bǔ)的DNA或 RNA。本發(fā)明方法設(shè)計(jì)合理，能夠提高檢測(cè)柑桔主要病害病原的敏感性、特異性及準(zhǔn)確性；高通量，一次檢 測(cè)即能檢出十種柑桔病害，十種病毒基本概括了柑桔主要病害病原；能夠發(fā)現(xiàn)各種柑桔病原物的混合感染。

本發(fā)明提出了一種基于細(xì)長(zhǎng)反應(yīng)腔的全基因組擴(kuò)增方法，其特征在于將多重鏈置換擴(kuò)增反應(yīng)體系注入細(xì)長(zhǎng)型的反應(yīng)腔中，完成對(duì)目標(biāo)基因組的全基因組擴(kuò)增。細(xì)長(zhǎng)形的反應(yīng)腔體將多重鏈置換擴(kuò)增反應(yīng)體系相對(duì)分隔于一個(gè)細(xì)長(zhǎng)的反應(yīng)腔中，各微觀反應(yīng)單元之間的物質(zhì)交換和相互影響大為減少，因此各微觀反應(yīng)單元以一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的狀態(tài)發(fā)生反應(yīng)，目標(biāo)核酸各個(gè)片段之間的擴(kuò)增一致性得到很大提升。同時(shí)，基于細(xì)長(zhǎng)反應(yīng)腔的多重鏈置換擴(kuò)增，不需要預(yù)先制備微液滴發(fā)生裝置或復(fù)雜反應(yīng)微腔，并且在系統(tǒng)調(diào)試和擴(kuò)增反應(yīng)的過(guò)程中，不需要對(duì)微量液體進(jìn)行精密和復(fù)雜的控制，

 紅樹植物是生長(zhǎng)在海岸潮間帶環(huán)境的木本植物，包含了不同分類類群的數(shù)十個(gè)物種，是研究適應(yīng)性趨同進(jìn)化的極佳對(duì)象。課題組選擇了三個(gè)主要的紅樹植物類群共16種代表性的紅樹物種，進(jìn)行了全基因組或轉(zhuǎn)錄組測(cè)序組裝，在全基因組水平檢測(cè)趨同進(jìn)化。通過(guò)系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)三個(gè)紅樹植物類群起源的時(shí)間十分接近，共同經(jīng)歷了歷史上海平面的升降，并逐步適應(yīng)潮間帶環(huán)境。論文進(jìn)一步發(fā)展了準(zhǔn)確估計(jì)分子水平趨同進(jìn)化的方法，以陸生植物為對(duì)照，通過(guò)檢測(cè)趨同氨基酸替代的方法，成功收集到70多個(gè)在紅樹植物中趨同進(jìn)化的基因。此外還發(fā)現(xiàn)紅樹植物更多的趨同進(jìn)化發(fā)生在氨基酸組成和氨基酸替代模式的改變。相比于陸生植物，紅樹植物趨同地改變了9種氨基酸的使用頻率，更多地發(fā)生了平常少見的氨基酸替代模式。這種氨基酸組成的趨同進(jìn)化有助于紅樹植物適應(yīng)高鹽、動(dòng)蕩且營(yíng)養(yǎng)貧瘠的海岸潮間帶環(huán)境。這項(xiàng)研究通過(guò)合適的物種選取、大量的基因組數(shù)據(jù)和完備的對(duì)照組設(shè)置，首次真正在基因組水平上準(zhǔn)確地檢測(cè)出趨同氨基酸替代位點(diǎn)。