揭示轉(zhuǎn)錄因子Sox2調(diào)節(jié)體細胞重編程的新機制
揭示了轉(zhuǎn)錄因子Sox2同時結(jié)合DNA和RNA并協(xié)同調(diào)控體細胞重編程的新機制,著重強調(diào)了在體細胞重編程過程中Sox2與RNA的直接相互作用的功能。?通過PAR-CLIP和RNA SELEX確認了Sox2與RNA直接相互作用,進一步的測序分析發(fā)現(xiàn)Sox2偏好性結(jié)合一個CCCY核心基序和一個CGCG的二級基序。隨后,研究人員利用EMSA和RNA免疫沉淀(RNA-immunoprecipitation assay)等手段確定了Sox2的RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(RBM),該結(jié)構(gòu)域具有優(yōu)先結(jié)合富含GC的RNA序列的特征。另外,通過RNA fishing實驗和競爭性結(jié)合實驗等的進一步分析,發(fā)現(xiàn)在DNA和RNA共同存在的情況下,Sox2使用其HMG結(jié)構(gòu)域結(jié)合同源DNA序列,并同時利用RBM結(jié)構(gòu)域在體外介導(dǎo)三元RNA/Sox2/DNA復(fù)合物的形成。除此之外,通過比較Oct4、Klf4、c-Myc (OKM)“雞尾酒”以及不同Sox2突變體誘導(dǎo)下iPSC生成的效率發(fā)現(xiàn),刪除Sox2 的RBM結(jié)構(gòu)域會影響iPSC的生成,并且顯著地改變了體細胞重編程過程中的選擇性剪接事件。 該研究加深了人們對Sox2蛋白調(diào)控多能性重編程機制的理解,進一步闡明了DRBPs對RNA代謝的調(diào)控機制。
中山大學(xué)
2021-04-13