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左永春教授課題組在利用人工智能篩選早期胚胎發(fā)育關鍵標記研究中取得新進展
人類早期胚胎發(fā)育雖然只有大約7天的時間，但是卻經歷了關鍵的分子事件，其中包括合子基因組激活（ZGA）和早期胚胎細胞的命運決定。伴隨測序技術的進步，單細胞測序技術可以有效地揭示早期胚胎發(fā)育的細胞命運決定的轉錄圖譜，但是單細胞轉錄組數(shù)據(jù)也存在許多問題，例如dropout事件（表達的基因未被檢測到），這使得差異分析方法在處理單細胞受到了限制。本研究中通過使用F-score算法和差異分析方法（limma，edgeR和DESeq）在人類早期胚胎單細胞轉錄組中得到兩個關鍵的基因集。通過比較先前研究中關鍵的基因來分析兩種方法的不同，POU5F1（OCT4）在細胞多能性的獲得和維持中起到了重要的作用，但是在差異分析方法中卻被排除，而F-score算法卻可以獲得。我們通過研究基因的表達趨勢發(fā)現(xiàn)，差異分析方法對于在多個時期高表達的基因會被排除，這對于胚胎發(fā)育中的細胞的異質性是十分不利的。
內蒙古大學
2021-02-01
清華大學生命學院頡偉課題組發(fā)文揭示DNA甲基化通過去記憶化構建早期胚胎發(fā)育的表觀屏障
早期胚胎發(fā)育起始于高度特化的精子和卵子的結合，從而形成全能性的受精卵。在這個過程中，表觀遺傳信息重編程對于擦除親本表觀遺傳記憶和重建細胞全能性十分重要。
清華大學
2021-12-28