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一種估計基因組育種值的方法及裝置
本發(fā)明實施例提供一種估計基因組育種值的方法及裝置，該方法包括：根據(jù)矩陣M?1的子塊數(shù)和預設的MPI進程數(shù)n，確定MPI進程MPIi讀取的根據(jù)表型數(shù)據(jù)文件的記錄條數(shù)、矩陣A?1中的個體數(shù)和所述MPI進程數(shù)n，確定MPI進程MPIi讀取的系數(shù)矩陣Wi和根據(jù)MPI進程MPIi的系數(shù)矩陣Wi和確定待估計的基因組育種值。本發(fā)明實施例可以實現(xiàn)計算機資源與運算速度的最優(yōu)化，節(jié)約運算時間，提高工作效率。
中國農業(yè)大學
2021-04-11
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一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18及其應用
項目成果/簡介:本發(fā)明公開了一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含與SEQ?ID?NO.1序列互補的核苷酸序列,該基因編碼CCCH型鋅指蛋白18,可作為小麥穗發(fā)芽抗感品種的分子標記基因.該小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18為一種新的小麥抗穗發(fā)芽主效基因,利用其開發(fā)分子標記,可以迅速鑒定小麥是否為穗發(fā)芽抗性品種,也為小麥穗發(fā)芽抗性育種提供了新的基因資源.
安徽農業(yè)大學
2021-04-10
基因放療引起放射性腦損傷相關SNP標志物
放療是鼻咽癌首選的治療方式，而放療引起的放射性腦損傷是鼻咽癌患者最嚴重的晚期不良反應之 放療是鼻咽癌首選的治療方式，而放療引起的放射性腦損傷是鼻咽癌患者最嚴重的晚期不良反應之 一。該不良反應往往具有不可逆性，極大地影響患者的生活質量。放射性腦損傷一旦發(fā)生，治療頗為困 一。該不良反應往往具有不可逆性，極大地影響患者的生活質量。放射性腦損傷一旦發(fā)生，治療頗為困 難，因此，對接受放療的鼻咽癌患者進行放射性腦損傷發(fā)病風險預測，對高危個體提前采取針對性的保護措施，實現(xiàn)腫瘤的個體化治療，顯得尤為重要。 本發(fā)明公開了DISC1FP1基因上的SNP位點rs10501719作為與腫瘤放療引起的放射性腦損傷發(fā)病風險相 關的標志物的應用。同時，制備得到一種預測腫瘤放療引起的放射性腦損傷發(fā)病風險的試劑盒，利用該試 劑盒檢測SNP標志物分型，聯(lián)合患者臨床信息可以更加全面準確的評估鼻咽癌患者發(fā)生放射性腦損傷的患 病風險。
中山大學
2021-04-10
SARS-CoV-2基因組分析進化和起源的研究
2020年3月8日，安徽師范大學在bioRxiv上上傳了一篇題為Genome-widedata inferring the evolution and population demography of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) 的研究分析，作者使用10個新測序的SARS-CoV-2基因組，并結合GISAID數(shù)據(jù)庫中的136個基因組，通過不同的分析方法（如EBSP、錯配和中性檢測等）研究前三個月數(shù)據(jù)的遺傳變異和統(tǒng)計。 結果顯示80個單倍型共有183個突變位點，包括27個簡約性信息位點和156個單一位點。對遺傳多樣性的滑動窗口分析表明，SARS-CoV-2基因組豐度的變化有一定范圍，這可以解釋目前這種病毒的廣泛和高適應性。遺傳學分析不支持穿山甲是中間宿主。在最初的單倍型（H14）中，一個患者樣本居住在華南海鮮市場附近（約2公里），這表明患者有無意識接觸該市場史的可能性很高。然而，基于這個線索，也無法準確斷定這個市場是否是SARS-CoV-2的起源中心。此外，從這個市場收集的16個基因組，包含10個單倍型，表明市場在短期內出現(xiàn)循環(huán)感染，這可能導致武漢和其他地區(qū)爆發(fā)SARS-CoV-2。EBSP結果顯示，第一個估計的擴展日期從2019年12月7日開始，這表明SARS-CoV-2的傳染可能在11月中下旬開始。
安徽師范大學
2021-04-10
一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18及其應用
本發(fā)明公開了一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含與SEQ?ID?NO.1序列互補的核苷酸序列,該基因編碼CCCH型鋅指蛋白18,可作為小麥穗發(fā)芽抗感品種的分子標記基因.該小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18為一種新的小麥抗穗發(fā)芽主效基因,利用其開發(fā)分子標記,可以迅速鑒定小麥是否為穗發(fā)芽抗性品種,也為小麥穗發(fā)芽抗性育種提供了新的基因資源.
安徽農業(yè)大學
2021-04-29
VvSUC27基因在促進植物攝取外界蔗糖中的應用
本發(fā)明涉及基因工程技術領域，具體公開了VvSUC27基因(GenBank登錄號：AF021810)在促進植物攝取外界蔗糖中的應用以及其在促進植物生長(尤其是在弱光環(huán)境或無光環(huán)境中生長)中的應用。本發(fā)明通過過表達VvSUC27基因，促進了植物攝取外界蔗糖，同時可使轉基因植物出現(xiàn)快速生長的表型，并且可以在微光甚至使無光下快速生長，證實了該基因的一個新的功能應用。VvSUC27基因的克隆和轉基因的應用，有望應用于肉質根或塊根植物及花卉等植物的培育中，使得植物即使在無光下也能快速生長，有利于節(jié)約光能減少能源的浪費。
中國農業(yè)大學
2021-04-11
預測重型肝炎病情基因的甲基化檢測方法及試劑
本發(fā)明涉及預測重型肝炎病情基因的甲基化狀態(tài)檢測的方法及試劑，提取病人外周血單個核細胞 DNA 進行亞硫酸氫鹽修飾后，分別用谷胱甘 肽 S-轉移酶 M3 甲基化（M）特異性和非甲基化（U）特異性引物對進行甲基化 特異性聚合酶鏈式反應，根據(jù)擴增產物判斷其甲基化狀態(tài)，有助于臨床醫(yī)生判 定重型肝炎患者的病情和指導治療。
山東大學
2021-04-13
創(chuàng)制轉基因技術中帶有安全篩選標記的安全轉化載體
選擇標記轉基因作物已成為近年來植物基因工程技術研究的重 點之一，隨著轉基因作物產品的商品化，轉基因植物的生物安全性受 到公眾越來越多的關注，尤其是目前抗生素標記基因在植物遺傳轉化 過程中的廣泛應用，使人們對這些標記基因可能帶來的潛在危害性心 存疑慮，抗性標記基因的存在嚴重地阻礙了轉基因植物的商品化進程 和轉化技術本身的有效性。 本項目培育的無抗生素標記基因（可視化標記基因）在建立高效、 安全、規(guī)模化的轉基因作物技術體系方面取得突破，以紫色幼芽作為 沙 門 屎 腸 副溶血弧 霍 亂 小 腸 結 腸 親水氣單 糞 腸 金 黃 色 肺炎克雷 鉤端螺 嗜 肺 軍 志 賀 綠 膿可視篩選標記代替抗生素篩選標記，構建了新型轉化載體并應用于作 物，已申請 2 項發(fā)明專利。
南開大學
2021-04-13
基因轉錄延伸復合體形成及作用機制的研究
近日，東南大學生命科學與技術學院“發(fā)育與疾病相關基因”教育部重點實驗室林承棋和羅卓娟課題組在國際頂級期刊《Science Advances》雜志發(fā)表了題為ENL initiates multivalent phase separation of the Super Elongation Complex (SEC) in controlling rapid transcriptional activation的文章，闡明了有關基因轉錄延伸復合體形成及作用機制的研究工作成果。東南大學研究團隊的研究揭示了SEC介導的多價相分離在RNA聚合酶II轉錄暫停釋放中起著關鍵作用，并從全新的角度為基因快速協(xié)調性轉錄激活程序的機制探索提供了新的認識。
東南大學
2021-04-11
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口蹄疫與偽狂犬病二價基因工程疫苗
研發(fā)階段/n口蹄疫（FMD）是引起的人及偶蹄動物共患的一種烈急性、高度接觸性、發(fā)熱性傳染病。FMD在世界上許多國家流行，造成重大的經(jīng)濟損失和政治影響。口蹄疫病毒（FMDV）屬于小RNA病毒科（Picornaviridae），口蹄疫病毒屬（Aphthovirus），該病毒為單股正鏈小RNA病毒，基因組長約8500個核苷酸，主要由結構基因（P1區(qū)）和非結構基因（P2、P3區(qū)）等構成。該發(fā)明具體涉及一種新的含有口蹄疫病毒主要免疫原性基因的重組偽狂犬病弱毒疫苗株，該毒株屬于豬偽狂犬病毒：Pseudorabi
華中農業(yè)大學
2021-01-12