熱泉微生物培養(yǎng)策略
通過高通量測序及共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)分析預(yù)測熱泉菌席微生物的互作模式的思路,實現(xiàn)了綠彎菌的定向分離(圖1)。通過對潛在互作的微生物驗證,確定了一株具有廣泛促生活性的菌株Tepidimonas sp. SYSU G00190W;基于此,團隊建立了基于物種互作的“SCM-定向分離”策略,成功分離到大量之前難以培養(yǎng)的微生物類群;最后作者還對其基因組和代謝組做了進一步機理解析和實驗驗證。? 本研究首次應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)預(yù)測的方法實現(xiàn)了熱泉菌席生境中未培養(yǎng)綠彎菌的定向培養(yǎng)。基于兩株代表性菌株的互作研究,初步闡明了熱泉菌席中綠彎菌(自養(yǎng)微生物,優(yōu)勢類群)和溫單胞菌(異養(yǎng)微生物,稀有類群)之間的互作關(guān)系,并為理解貧營養(yǎng)生境中優(yōu)勢類群與稀有類群的相互作用奠定了一定的基礎(chǔ),提出的分離策略為其它環(huán)境中難培養(yǎng)微生物的可培養(yǎng)化提供了思路。
中山大學
2021-04-13