基于細(xì)胞類型解卷積的癌癥診斷芯片及設(shè)備
在臨床和科研中,識別細(xì)胞類型是癌癥診斷、血液分析等的重要內(nèi)容,項(xiàng)目擬開發(fā)一套基于細(xì)胞類型解卷積算法,并與基因芯片結(jié)合,建成細(xì)胞類型分析設(shè)備。 在血細(xì)胞檢測、免疫力評估、癌癥診斷、干細(xì)胞移植、腫瘤微環(huán)境分析等臨床應(yīng)用中,必然要判斷樣本中的細(xì)胞類型和豐度。目前,臨床使用的方法(染色、流式細(xì)胞等)存在:細(xì)胞類型判斷不準(zhǔn)、過分依賴抗體、流程復(fù)雜等缺陷。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(如Drop-Seq、10X genomics等)由于細(xì)胞泄露等原因,檢測基因不全,導(dǎo)致對細(xì)胞類型的判斷有誤,且需要新鮮樣本,實(shí)驗(yàn)較復(fù)雜,后續(xù)分析復(fù)雜。 因此,在臨床和科研中,亟需一種能快速、簡潔、準(zhǔn)確地分析樣本中所有細(xì)胞類型及其豐度的方法和設(shè)備。項(xiàng)目將開發(fā)一種基于解卷積的細(xì)胞類型識別算法,并和基因芯片技術(shù)結(jié)合,集成為細(xì)胞類型分析設(shè)備。只通過一組基因的表達(dá)水平,判定樣本中所有細(xì)胞類型及其豐度;且可根據(jù)組織類型定制芯片,擴(kuò)展應(yīng)用。該設(shè)備可用于臨床和科研中關(guān)于血液疾病、癌癥、免疫分析等,成本低、操作簡單、準(zhǔn)確性好。
東南大學(xué)
2021-04-13