基于新一代測(cè)序的生物信息云平臺(tái)及其在科研和醫(yī)療健康領(lǐng)域的應(yīng)用
1 項(xiàng)目簡(jiǎn)介本項(xiàng)目建立的生物云平臺(tái),以基于 Web 的方式提供服務(wù),用戶可以輕松快速獲取服務(wù),國(guó)內(nèi)外普遍缺乏成熟的技術(shù),標(biāo)準(zhǔn)和平臺(tái)。我們首次把獨(dú)具特色的機(jī)器學(xué)習(xí)模型預(yù)測(cè)算法與最新的高通量測(cè)序方法( non-polyA RNA-seq) 相結(jié)合。我們的研究對(duì)象為長(zhǎng)鏈非編碼 RNA( non-PolyA),目前國(guó)際上還很少有人通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)疾病的 lncRNA 進(jìn)行全面預(yù)測(cè)分析和功能分類(lèi)。隨著測(cè)序速度不斷提高,測(cè)序成本不斷降低,本項(xiàng)目將來(lái)可以發(fā)展為面向人民大眾的個(gè)性化醫(yī)療服務(wù)的平臺(tái)。 圖 1 生物醫(yī)學(xué)信息云平臺(tái)的產(chǎn)業(yè)化方向 http://www.incrna.org圖 2 生物醫(yī)學(xué)信息云平臺(tái)的應(yīng)用程序一覽 http://bioinfo.life.tsinghua.edu.cn/serve 本項(xiàng)目使用的核心技術(shù)“基于整合性生物信息云計(jì)算和新一代測(cè)序技術(shù)( incRNA) 的非編碼基因組疾病(如癌癥)檢測(cè)技術(shù)平臺(tái)”已經(jīng)通過(guò)軟件查新認(rèn)證( 20121022044750914)。正在準(zhǔn)備申請(qǐng)國(guó)家版權(quán)局軟件著作權(quán)登記證書(shū)。2 效益分析( 1)隨著新一代高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,生物信息數(shù)據(jù)爆炸式增長(zhǎng),數(shù)據(jù)解讀成為生物醫(yī)學(xué)研究和臨床應(yīng)用的巨大問(wèn)題,我們團(tuán)隊(duì)依托清華大學(xué)生命學(xué)院魯志實(shí)驗(yàn)室在生物信息學(xué),尤其是在 lncRNA 領(lǐng)域的技術(shù)專(zhuān)長(zhǎng)開(kāi)發(fā)的云計(jì)算平臺(tái)將為廣大科研工作和和臨床用戶提供可靠的數(shù)據(jù)分析云服務(wù),提高他們的科研效率,為科學(xué)的發(fā)展做出貢獻(xiàn)。 ( 2)我們團(tuán)隊(duì)通過(guò)與中國(guó)人民解放軍總醫(yī)院,上海肝膽醫(yī)院等十多家臨床單位的合作,將為鑒定癌癥的早期診斷和藥物治療提供新的靶點(diǎn),這不僅會(huì)增強(qiáng)中國(guó)基礎(chǔ)臨床科學(xué)的發(fā)展,通過(guò)臨床應(yīng)用還會(huì)為病患者帶來(lái)癌癥早期診斷、健康管理等個(gè)性化醫(yī)療服務(wù),這將具有廣泛的社會(huì)效益。 ( 3)通過(guò)我們打造高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析云計(jì)算平臺(tái)和開(kāi)展以癌癥早期檢測(cè)為主要內(nèi)容的個(gè)性化醫(yī)療服務(wù),將為中國(guó)培養(yǎng)一批高水平的生物信息數(shù)據(jù)分析人才,這將增強(qiáng)中國(guó)在生物信息學(xué)方面的實(shí)力。
清華大學(xué)
2021-04-13