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2020年2月4日上海復旦大學公共衛生學院張永振團隊在《自然》雜志發表了與中國呼吸道疾病爆發相關的病毒的基因組序列，該病毒基因組從就職于出現首批患者的海鮮市場的一名病人身上獲得。基因組分析顯示，該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。 張永振及同事研究了一名41歲的男性海鮮市場工人，其于2019年12月26日在武漢一家醫院住院，表現出呼吸系統疾病癥狀，包括發燒、胸悶和咳嗽。聯合使用抗生素、抗病毒藥和糖皮質激素進行治療，但患者表現出呼吸衰竭，治療三天后病情無改善。團隊對從患者收集的支氣管肺泡灌洗液（肺分泌物）進行了基因組測序。他們鑒定出了一種新型病毒，并發現該病毒基因組與蝙蝠體內發現的SARS樣冠狀病毒有89.1%的核苷酸相似性。盡管從單個患者的分析中不可能得出該冠狀病毒是當前疫情爆發原因的結論，不過團隊的這些發現已被針對其他患者的獨立調查研究證實。 

本技術成果通過整合電化學、微機電和自動化控制技術，開發了一套適合于 出入境口岸動物疫病等的現場快速檢測設備 便攜式動物疫病現場檢測儀。檢 測儀在結構上不同于現有的進口濁度儀，采用自主開發的微機電加熱技術保證疫 病基因的高效等溫擴增，同時集成可視化微型紫外檢測模塊使得結果的觀察和判 斷更為方便。該儀器具備穩定的溫度控制電路、便捷的結果檢測方式，體積小方 便攜帶，且具有自主知識產權，避免了使用價格昂貴，且不便攜帶的實時濁度儀、 PCR儀或水浴鍋，適合于出入境口岸對動物疫病等進行現場的快速診斷或篩查。實驗樣機采用鏈置換聚合酶引導下的環介導等溫擴增反應生成大量焦磷酸 鎂沉淀和DNA產物的原理，包括四路并行的單色激光器和二極管陣列光電檢測 器，實現對樣本中的生物基因（DNA）進行實時檢測和分析。同時，利用磁珠 法提取核酸的基本理論，研制了手持式核酸提取裝置，對細胞中的核酸（DNA 和RNA）完成純化和提取，完成的樣本前處理工作，整個過程不需要離心機，單 個提取時間不超過30分鐘。從樣本前處理到后續的基因檢測，完成單個樣本檢 測的平均時間不超過60分鐘，可以實現對食品、農產品、肉制品、水產品中各類 病原微生物的快速檢測和現場查驗。

本發明公開了一種水稻側根控制基因OsIAA11編碼的蛋白質,其具有SEQ?ID?NO:2所示的氨基酸序列。本發明還同時公開了編碼上述蛋白質的基因,該基因具有SEQ?ID?NO:1所示的核苷酸序列。本發明的基因能用于構建具有水稻側根控制功能的轉基因水稻。由于側根的正常發生發育對維持水稻生長發育以及高產穩產是必不可少的,而且該基因僅影響側根發生發育,因此在分子育種中存在較大的應用潛力。

通過對個體全基因組單核苷酸多態性（SNP）信息與疾病表型的全基因組關聯分析，以及兩階段獨立人群驗證，最終在2942例鼻咽癌患者中發現了位于14號染色體上CEP128 基因啟動子區的變異位點rs17111237與放射性腦損傷的發生存在顯著關聯，攜帶危險型等位基因的個體CEP128基因的表達水平顯著較低。特別地，聯合臨床危險因素，攜帶危險基因型的高危鼻咽癌患者放射性腦損傷五年發病風險為攜帶保護基因型的低危患者的3倍。CEP128基因編碼中心體蛋白，在纖毛形成和細胞周期調控中起著至關重要的作用。研究表明，CEP128可通過與CASK、CEP72等蛋白相互作用，維持纖毛的功能并調節細胞對射線等外界刺激的反應。我們進一步以放射性腦損傷的主要靶細胞——神經膠質細胞為模型探究了CEP128基因的功能，通過克隆形成實驗發現敲減CEP128基因的表達顯著增加了神經膠質細胞的放射敏感性。

開發了一種還原敏感的多功能載體材料，載體的疏水性嵌段包載抗腫瘤光動力藥物Ce6，攜帶NTA基團的嵌段則通過NTA和Cas9蛋白末端His標簽之間的特異性結合高效負載Cas9蛋白/sgRNA復合物，然后通過靜電組裝在外層引入靶向腫瘤組織的iRGD分子。這樣的載體結構設計和藥物聯合輸送為實現腫瘤組織特異性的基因編輯和聯合治療提供了可行性。納米藥物靶向輸送至腫瘤細胞后，在近紅外光的輻照下，Ce6產生的活性氧使溶酶體破裂，使納米藥物從溶酶體中逃逸出來，NTA和載體聚合物之間的二硫鍵可響應胞質內的谷胱甘肽等還原劑而斷裂，從而將Cas9蛋白/sgRNA復合物從載體上釋放出來，執行基因編輯功能。在正常的組織中，由于沒有近紅外光的輻照，Cas9蛋白/sgRNA復合物難以從溶酶體中逃逸，無法執行基因編輯的功能。通過紅外光輻照和還原敏感設計實現了腫瘤組織特異的基因編輯。此外，腫瘤細胞在受到Ce6所生成活性氧攻擊時，會上調Nrf2（一種活性氧代謝的關鍵蛋白）的表達，提高腫瘤細胞對活性氧的耐受性。使用靶向Nrf2基因的sgRNA，可以通過聯合輸送的Cas9蛋白/sgRNA復合物使Nrf2基因失活，提高腫瘤細胞對活性氧的敏感性。總而言之，通過多功能載體聯合輸送Ce6和Cas9蛋白/sgRNA復合物，一方面實現了腫瘤特異性的基因編輯，另一方面也實現了基因編輯和光動力治療的聯合治療，協同提高了基因編輯的特異性和治療效果，為基因編輯技術的發展提供了一個新的方向。

在基因治療中，載體將治療基因導入靶細胞，使其與宿主染色體整合為一體或在宿主細胞中表達特定蛋白質，從而治療因基因異常或缺陷而導致的疾病。因此，基因治療成敗的關鍵在于基因遞送系統。基因治療市場未來市場空間巨大。據Clinical Trial數據，目前基因藥物以病毒載體為主，約占所有載體的70%，未來病毒載體市場前景十分廣闊。2017年FDA批準羅氏公司的基于AAV病毒載體的基因療法Luxturna用來治療患有特定遺傳性眼疾的兒童和成人患者。從實驗室簡單的基因過表達、體外的基因干擾、基因編輯（CRISPR/Cas9）技術 、CAR-T免疫療法技術、到腫瘤、神經、代謝、眼科、心臟、肝臟、肺等臨床前動物和臨床人體試驗的研究，基因病毒載體的應用無處不在。我國離世界先進水平在技術上存在巨大差距，基因運載工具由于開發難度大，生產工藝要求高，目前我國和國際先進技術相比還存在非常大的差距，國內基因治療藥物的研發還處于起步階段，還存在巨大的市場需求沒有得到滿足，而目前美國FDA已有批準的的基因治療藥物收費非常高昂。    目前采用病毒載體的基因療法已經成功用于血友病，先天性黑矇，脊髓肌肉萎縮癥等單基因疾病的治療。

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本發明涉及豬ApoE基因敲除載體及其構建方法與應用，本發明的載體命名為pApoEKO-DTA-M，其核苷酸序列如SEQ?ID?NO : 1所示，其構建方法包括如下步驟：(1)擴增豬ApoE基因側翼序列作為基因打靶的長臂和短臂；(2)短臂與打靶載體ploxp分別酶切、連接后，再與長臂連接；去除tk，與dta基因片段連接；(3)在長短臂之間插入特異性啟動子Cre，構建得到ApoE基因敲除載體。本發明的豬ApoE基因敲除載體可用于培育敲除了ApoE基因的豬，用于動脈硬化模型動物的制備。