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優(yōu)質(zhì)健康豬重要候選基因挖掘分子育種標記技術(shù)
可以量產(chǎn)/n1.構(gòu)建了豬基因素材的高效挖掘平臺與分子育種標記開發(fā)技術(shù)體 系。率先設(shè)計、建立了豬第一代寡核苷酸基因芯片的技術(shù)操作流程；優(yōu) 化了豬基因芯片的非特異過濾方法；開發(fā)了豬 CRISPA/Cas9 基因組編輯 系統(tǒng)的 sgRNA 設(shè)計及脫靶效應(yīng)評估軟件獲得軟件著作權(quán)，創(chuàng)建了多個病 毒和細菌刺激的細胞和活體模型，發(fā)展了多個基因組學技術(shù)，實現(xiàn)了豬 基因素材高效挖掘平臺與分子育種標記開發(fā)技術(shù)體系的構(gòu)建。2.開發(fā)了 10 個用于優(yōu)質(zhì)健康豬培育、具有自主知識產(chǎn)權(quán)的分子育種 標記。篩選出豬重要
華中農(nóng)業(yè)大學
2021-01-12
轉(zhuǎn)基因抗蟲棉新品種華雜棉H318
可以量產(chǎn)/n華雜棉H318是以陸地棉B0011品系為母本，轉(zhuǎn)Bt/CpTI雙價抗蟲基因陸地棉4-5品系為父本，進行人工去雄雜交配制的雜種一代優(yōu)勢組合。2009年通過國家審定，同時獲得農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物生產(chǎn)應(yīng)用安全證書。該品種的主要特點：產(chǎn)量高：兩年長江區(qū)試結(jié)果表現(xiàn)為子棉、皮棉和霜前皮棉畝產(chǎn)分別為246.3kg/666.7m2、101.9kg/666.7m2、95.5kg/666.7m2，分別為對照湘雜棉8號的104.7%、109.7%、110.5%；纖維品質(zhì)優(yōu)良：試驗統(tǒng)一送樣測試，長度30.3毫米，斷裂
華中農(nóng)業(yè)大學
2021-01-12
癌細胞簡化自身基因組冗余序列以便快速增殖
核糖體DNA編碼核糖體的關(guān)鍵組分-核糖體RNA，對蛋白質(zhì)翻譯和細胞增殖具有重要的作用。然而，核糖體DNA的拷貝數(shù)在人類基因組中是易變的，由于技術(shù)手段的限制，人們對哺乳動物細胞如何維持和控制核糖體DNA的拷貝數(shù)和穩(wěn)定性所知甚少。本研究應(yīng)用計算生物學和數(shù)字微滴式PCR（Droplet digital PCR）方法分析了正常和癌癥狀態(tài)下，人類和小鼠基因組中核糖體DNA的拷貝數(shù)和序列變異情況。發(fā)現(xiàn)人類癌癥基因組中核糖體DNA拷貝數(shù)出乎意料地顯著減少，并伴隨許多其他基因拷貝數(shù)的變異。此外，癌癥基因組的核糖體DNA序列也更易發(fā)生突變。 根據(jù)文獻證據(jù)的提示，研究團隊進一步探討了癌癥模型中mTOR（哺乳動物雷帕霉素靶蛋白，mammalian target of rapamycin）功能與核糖體DNA拷貝數(shù)減少的關(guān)系。發(fā)現(xiàn)Pten基因（mTOR信號通路的負調(diào)控因子）敲除的白血病小鼠模型中，癌癥造血干細胞早期就出現(xiàn)核糖體DNA拷貝數(shù)的減少，但其細胞增殖、核糖體RNA合成和蛋白翻譯水平等均顯著提高。說明核糖體DNA拷貝數(shù)丟失是mTOR通路過表達的癌癥的一種常見特征。這一研究結(jié)果提示，測定核糖體DNA拷貝數(shù)，可成為預(yù)測癌癥對DNA損傷藥物敏感性的一個簡單而有效的新指標。
中山大學
2021-04-13
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王國俊研究員與合作團隊聯(lián)合發(fā)現(xiàn)病毒編碼蛋白新機制:病毒基因與人類基因融合產(chǎn)生新型嵌合蛋白
RNA病毒一直給人類健康帶來巨大威脅。分節(jié)段負鏈RNA病毒（sNSV）通過自身攜帶的RNA聚合酶搶奪宿主細胞mRNA的5’端帽子結(jié)構(gòu)，轉(zhuǎn)錄為病毒mRNA，合成的病毒mRNA是由宿主基因和病毒基因組成的嵌合mRNA。此過程被稱為“Cap-snatching”，是sNSV復(fù)制周期中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。 一直以來，人們認為：病毒mRNA翻譯的蛋白只包含病毒基因的開放閱讀框（ORF），宿主來源的mRNA序列的作用是其5’端帽子結(jié)構(gòu)可供宿主細胞翻譯體系識別，其他宿主源遺傳信息沒有合成病毒蛋白的功能。 該研究揭示了病毒編碼蛋白的新機制。 研究發(fā)現(xiàn)，病毒搶奪過來的宿主源mRNA片段，不僅起到5’端帽子結(jié)構(gòu)的作用，而且這些宿主源mRNA片段包括起始密碼子（AUG），宿主細胞可以從宿主的AUG開始翻譯，編碼兩類宿主與病毒的嵌合蛋白。若宿主源AUG與原有病毒蛋白ORF在同一讀碼框中（in-frame），產(chǎn)生的蛋白為 N 端延長的宿主與病毒嵌合蛋白； 若宿主源AUG與原有病毒蛋白ORF不在同一讀碼框中（off-frame），產(chǎn)生的蛋白為新型的嵌合蛋白（Novel host-virus encoded proteins）。 進一步研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)：流感病毒感染細胞后可以產(chǎn)生上述兩類嵌合蛋白，這些嵌合蛋白可以誘導T細胞反應(yīng)，并且與病毒的毒力相關(guān)。該研究提示，這種新的病毒蛋白編碼機制可能不僅僅局限于流感病毒，在其他人類病毒、動物病毒和植物病毒中也廣泛存在這種宿主與病毒嵌合蛋白的編碼機制。 本研究是由美國紐約西奈山伊坎醫(yī)學院（Icahn School of Medicine at Mount Sinai）牽頭，多國科研工作者共同合作完成。
內(nèi)蒙古大學
2021-02-01
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轉(zhuǎn)基因小鼠骨骼肌營養(yǎng)不良模型的構(gòu)建方法
本發(fā)明提供一種轉(zhuǎn)基因小鼠骨骼肌營養(yǎng)不良模型的構(gòu)建方法，其是利用Tet?on系統(tǒng)與轉(zhuǎn)基因技術(shù)構(gòu)建可以在肌肉內(nèi)特異性誘導表達microRNA29a和microRNA29b1的轉(zhuǎn)基因小鼠，可作為人Ullrich型先天性肌營養(yǎng)不良的實驗動物模型，與Ullrich型先天性肌營養(yǎng)不良的表現(xiàn)相同，本發(fā)明構(gòu)建的實驗動物模型在生長過程中也存在嚴重的呼吸問題，約17％的小鼠會在斷乳前由于呼吸障礙而死亡，全部轉(zhuǎn)基因鼠會出現(xiàn)骨骼肌發(fā)育不良，為人Ullrich型先天性肌營養(yǎng)不良的治療與研究提供了有力的工具。
中國農(nóng)業(yè)大學
2021-04-11
一種估計基因組育種值的方法及裝置
本發(fā)明實施例提供一種估計基因組育種值的方法及裝置，該方法包括：根據(jù)矩陣M?1的子塊數(shù)和預(yù)設(shè)的MPI進程數(shù)n，確定MPI進程MPIi讀取的根據(jù)表型數(shù)據(jù)文件的記錄條數(shù)、矩陣A?1中的個體數(shù)和所述MPI進程數(shù)n，確定MPI進程MPIi讀取的系數(shù)矩陣Wi和根據(jù)MPI進程MPIi的系數(shù)矩陣Wi和確定待估計的基因組育種值。本發(fā)明實施例可以實現(xiàn)計算機資源與運算速度的最優(yōu)化，節(jié)約運算時間，提高工作效率。
中國農(nóng)業(yè)大學
2021-04-11
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一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18及其應(yīng)用
項目成果/簡介:本發(fā)明公開了一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含與SEQ?ID?NO.1序列互補的核苷酸序列,該基因編碼CCCH型鋅指蛋白18,可作為小麥穗發(fā)芽抗感品種的分子標記基因.該小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18為一種新的小麥抗穗發(fā)芽主效基因,利用其開發(fā)分子標記,可以迅速鑒定小麥是否為穗發(fā)芽抗性品種,也為小麥穗發(fā)芽抗性育種提供了新的基因資源.
安徽農(nóng)業(yè)大學
2021-04-10
基因放療引起放射性腦損傷相關(guān)SNP標志物
放療是鼻咽癌首選的治療方式，而放療引起的放射性腦損傷是鼻咽癌患者最嚴重的晚期不良反應(yīng)之 放療是鼻咽癌首選的治療方式，而放療引起的放射性腦損傷是鼻咽癌患者最嚴重的晚期不良反應(yīng)之 一。該不良反應(yīng)往往具有不可逆性，極大地影響患者的生活質(zhì)量。放射性腦損傷一旦發(fā)生，治療頗為困 一。該不良反應(yīng)往往具有不可逆性，極大地影響患者的生活質(zhì)量。放射性腦損傷一旦發(fā)生，治療頗為困 難，因此，對接受放療的鼻咽癌患者進行放射性腦損傷發(fā)病風險預(yù)測，對高危個體提前采取針對性的保護措施，實現(xiàn)腫瘤的個體化治療，顯得尤為重要。 本發(fā)明公開了DISC1FP1基因上的SNP位點rs10501719作為與腫瘤放療引起的放射性腦損傷發(fā)病風險相 關(guān)的標志物的應(yīng)用。同時，制備得到一種預(yù)測腫瘤放療引起的放射性腦損傷發(fā)病風險的試劑盒，利用該試 劑盒檢測SNP標志物分型，聯(lián)合患者臨床信息可以更加全面準確的評估鼻咽癌患者發(fā)生放射性腦損傷的患 病風險。
中山大學
2021-04-10
SARS-CoV-2基因組分析進化和起源的研究
2020年3月8日，安徽師范大學在bioRxiv上上傳了一篇題為Genome-widedata inferring the evolution and population demography of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) 的研究分析，作者使用10個新測序的SARS-CoV-2基因組，并結(jié)合GISAID數(shù)據(jù)庫中的136個基因組，通過不同的分析方法（如EBSP、錯配和中性檢測等）研究前三個月數(shù)據(jù)的遺傳變異和統(tǒng)計。 結(jié)果顯示80個單倍型共有183個突變位點，包括27個簡約性信息位點和156個單一位點。對遺傳多樣性的滑動窗口分析表明，SARS-CoV-2基因組豐度的變化有一定范圍，這可以解釋目前這種病毒的廣泛和高適應(yīng)性。遺傳學分析不支持穿山甲是中間宿主。在最初的單倍型（H14）中，一個患者樣本居住在華南海鮮市場附近（約2公里），這表明患者有無意識接觸該市場史的可能性很高。然而，基于這個線索，也無法準確斷定這個市場是否是SARS-CoV-2的起源中心。此外，從這個市場收集的16個基因組，包含10個單倍型，表明市場在短期內(nèi)出現(xiàn)循環(huán)感染，這可能導致武漢和其他地區(qū)爆發(fā)SARS-CoV-2。EBSP結(jié)果顯示，第一個估計的擴展日期從2019年12月7日開始，這表明SARS-CoV-2的傳染可能在11月中下旬開始。
安徽師范大學
2021-04-10
一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18及其應(yīng)用
本發(fā)明公開了一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含與SEQ?ID?NO.1序列互補的核苷酸序列,該基因編碼CCCH型鋅指蛋白18,可作為小麥穗發(fā)芽抗感品種的分子標記基因.該小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18為一種新的小麥抗穗發(fā)芽主效基因,利用其開發(fā)分子標記,可以迅速鑒定小麥是否為穗發(fā)芽抗性品種,也為小麥穗發(fā)芽抗性育種提供了新的基因資源.
安徽農(nóng)業(yè)大學
2021-04-29