利用TCGA數(shù)據(jù)庫資源發(fā)現(xiàn)直腸癌相關(guān)microRNA分子標志物的方法及系統(tǒng)和應(yīng)用
本發(fā)明公開了一種利用TCGA數(shù)據(jù)庫資源發(fā)現(xiàn)直腸癌相關(guān)microRNA分子標志物的方法及系統(tǒng)和應(yīng)用?;诠矓?shù)據(jù)資源例如癌癥基因組圖譜TCGA數(shù)據(jù)庫的直腸癌miRNA測序數(shù)據(jù),合理運用開放性的大數(shù)據(jù)資源和多樣的生物信息學(xué)分析手段,對miRNA表達數(shù)據(jù)進行分析處理,識別與直腸癌等復(fù)雜疾病相關(guān)的miRNA。包括:樣本數(shù)據(jù)下載和整理;對miRNA表達數(shù)據(jù)的差異表達分析;將miRNA按照變化幅度排序;選定靶基因;對靶基因進行功能分析。本發(fā)明能解決不擅長整合現(xiàn)有網(wǎng)絡(luò)資源、不熟悉miRNA相關(guān)的最常用數(shù)據(jù)庫及前沿
東南大學(xué)
2021-04-14