發(fā)布包含兩萬多擬南芥公共RNA-seq文庫的生物大數(shù)據(jù)在線分析平臺
翟繼先課題組此次發(fā)布的數(shù)據(jù)庫(Arabidopsis RNA-seq database, ARS)整合了來自GEO、SRA、ENA和DDBJ數(shù)據(jù)庫的20,068個擬南芥RNA-seq數(shù)據(jù),提供了“Google-style”在線查詢工具。該研究對所有文庫進行了基因表達水平定量和共表達網(wǎng)絡(luò)分析,并將所有文庫進行分類,總共涉及1176個突變體、1102種處理條件、12個組織和176個發(fā)育時期,同時也對突變體和處理條件分別同對應(yīng)的對照組進行差異表達分析。
南方科技大學(xué)
2021-04-14