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有關(guān)冷凍電鏡解析的人源蛋白酶體26S全酶高分辨
三
維動態(tài)結(jié)構(gòu)的研究
蛋白酶體是細(xì)胞中用來調(diào)控特定蛋白質(zhì)的濃度和清除錯誤折疊蛋白質(zhì)的主要機(jī)制的核心組成部分,是細(xì)胞中最普遍的不可或缺的大型全酶超分子復(fù)合機(jī)器之一,也是迄今為止發(fā)現(xiàn)的最大的蛋白降解機(jī)器。人源蛋白酶體全酶包含至少64個(gè)亞基,由蓋子 (Lid)和基座(Base)亞復(fù)合體組成的調(diào)控顆粒RP(Regulatory Particle)所激活。2016年,該課題組與其合作者在《美國科學(xué)院院刊》報(bào)道了人源蛋白酶體的基態(tài)近原子分辨的冷凍電鏡結(jié)構(gòu),以及三個(gè)亞納米分辨的RP-CP亞復(fù)合體亞穩(wěn)或過渡態(tài)的共存結(jié)構(gòu),并首次發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)亞穩(wěn)態(tài)構(gòu)象的CP的底物轉(zhuǎn)運(yùn)通道處于開放狀態(tài)(見PNAS 2016, 113: 12991-12996)。這一發(fā)現(xiàn)被德國馬普所Baumeister課題組及其合作者在2017年的一篇《美國科學(xué)院院刊》論文中通過酵母蛋白酶體全酶的冷凍電鏡亞納米精度分析進(jìn)一步證實(shí)、引用和比較(見PNAS 2017, 114, 1305-1310)。然而,在這些工作中,CP開放態(tài)的全酶結(jié)構(gòu)離近原子分辨還有較大距離,未能充分揭示人源蛋白酶體全酶的激活后的運(yùn)動行為。毛有東、歐陽頎課題組及其合作者在前期工作的基礎(chǔ)上,利用他們自主開發(fā)的基于統(tǒng)計(jì)流行算法的高性能計(jì)算軟件ROME(見PLoS ONE 2017, 12:e0182130)與優(yōu)化的冷凍電鏡處理方法,對ATP-γS結(jié)合狀態(tài)下的人源蛋白酶體的全酶冷凍電鏡單顆粒數(shù)據(jù)展開了深入分析,得到了6個(gè)共存的動態(tài)結(jié)構(gòu),其中包括3.6埃分辨率的基態(tài)結(jié)構(gòu),3.5埃的開放態(tài)CP結(jié)構(gòu),和三個(gè)CP開放態(tài)對應(yīng)的亞穩(wěn)簡并態(tài)全酶4.2埃,4.3埃和4.9埃的結(jié)構(gòu)。另外兩個(gè)中間態(tài)結(jié)構(gòu)分辨率為7.0埃和5.8埃。三個(gè)CP開放態(tài)對應(yīng)的全酶結(jié)構(gòu)的主要差別在于位于RP的AAA-ATPase激酶馬達(dá)模塊,伴隨其不同的構(gòu)象變化,至少有四個(gè)ATP-γS分子穩(wěn)定結(jié)合在不同的AAA-ATPase亞基上,為其在不同核酸結(jié)合狀態(tài)下形成的非穩(wěn)定動態(tài)構(gòu)象提供了重要證據(jù)。該研究首次觀察到位于AAA-ATPase激酶馬達(dá)模塊中心的底物轉(zhuǎn)運(yùn)通道呈現(xiàn)從螺旋到鞍形不同的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化,為進(jìn)一步分析底物和蛋白酶體全酶的相互作用奠定了重要基礎(chǔ)。人源蛋白酶體全酶AAA-ATPase馬達(dá)模塊中心的底物轉(zhuǎn)運(yùn)通道發(fā)生大幅度的拓?fù)渥儤?gòu)
北京大學(xué)
2021-04-11
【第57屆高博會系列報(bào)道之
三
】第二屆云端教學(xué)發(fā)展大會在陜西西安舉辦
大會以“云網(wǎng)融合教育創(chuàng)新突出應(yīng)用示范引領(lǐng)”為主題,聚焦教育信息化和教育資源數(shù)字化建設(shè),共研新形勢下教育變革路徑,共商新時(shí)代云端教學(xué)發(fā)展大計(jì),共助高校教育教學(xué)模式創(chuàng)新與發(fā)展。
中國高等教育學(xué)會
2022-08-06
一種基于InDel分子標(biāo)記鑒定辣椒雄性不育
三
系配套雜交種真實(shí)性和純度的方法
本發(fā)明提供了一種基于InDel分子標(biāo)記鑒定辣椒雄性不育三系配套雜交種真實(shí)性和純度的方法。其方法為:將辣椒雜交種和親本培育至芽苗期,提取DNA,應(yīng)用核心引物對雜交種和親本進(jìn)行篩選,只有共顯性標(biāo)記的引物可以作為該雜交種真實(shí)性鑒定的分子標(biāo)記。若辣椒雜交種和親本在核心引物庫中無法篩選出共顯性標(biāo)記,則結(jié)合次級核心引物庫中繼續(xù)篩選,直至篩選出共顯性標(biāo)記。本發(fā)明建立的快速、同時(shí)鑒定辣椒雄性不育三系配套雜交種真實(shí)
青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-01-12
華東師范大學(xué)科學(xué)家在
三
維拓?fù)潴w系中觀測到一維外爾費(fèi)米子
近日,華東師大精密光譜科學(xué)與技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室袁翔課題組在三維拓?fù)浣^緣體HfTe5中觀測到一維外爾費(fèi)米子。
華東師范大學(xué)
2022-10-11
基于聚焦離子束-掃描電子顯微鏡雙束的材料微納結(jié)構(gòu)精確
三
維重構(gòu)技術(shù)
基于聚焦離子束-掃描電子顯微鏡雙束(FIB-SEM)的切割-掃描操作, 能夠使材料的微納結(jié)構(gòu)在三維空間的精確重構(gòu)得以實(shí)現(xiàn)。經(jīng)過多年經(jīng)驗(yàn)的積累,已開發(fā)出一套針對擁有復(fù)雜微納結(jié)構(gòu)的金屬陶瓷復(fù)合材料進(jìn)行三維重構(gòu)的技術(shù)解決方案。該技術(shù)在固體氧化物燃料電池領(lǐng)域,為固體多孔電極材料的微納尺度精確定量分析提供了有力的技術(shù)支持。作為本領(lǐng)域的知名專家,美國西北工業(yè)大學(xué)的 Scott A. Barnett 教授曾在國際 SOFC 領(lǐng)域規(guī)模最大的年會 International Symposium on SOFC 中重
哈爾濱工業(yè)大學(xué)
2021-04-14
中國高等教育學(xué)會關(guān)于召開第
三
屆數(shù)字時(shí)代創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育研討會的通知
黨的二十大擘畫了中國式現(xiàn)代化的偉大藍(lán)圖,正式宣告我國已進(jìn)入創(chuàng)新型國家的行列。作為中國式教育現(xiàn)代化的有機(jī)組成,創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育現(xiàn)代化是聯(lián)結(jié)“科技、教育和人才”的核心樞紐。加快實(shí)現(xiàn)創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育現(xiàn)代化不僅是實(shí)現(xiàn)中國式教育現(xiàn)代化的自身之需,更是通往中國式現(xiàn)代化的必由之路。
中國高等教育學(xué)會
2023-09-22
Aigtek西安安泰電子 ATG-2000系列功率信號源 可輸出正弦波、方波、
三
角波、脈沖波
西安安泰電子科技有限公司
2022-06-01
四川大學(xué)化工過程裝備與
生物
醫(yī)藥實(shí)驗(yàn)教學(xué)平臺建設(shè)項(xiàng)目公開招標(biāo)采購公告
四川大學(xué)化工過程裝備與生物醫(yī)藥實(shí)驗(yàn)教學(xué)平臺建設(shè)項(xiàng)目招標(biāo)項(xiàng)目的潛在投標(biāo)人應(yīng)在www.scltzb.com獲取招標(biāo)文件,并于2022年06月14日10點(diǎn)30分(北京時(shí)間)前遞交投標(biāo)文件。
四川大學(xué)
2022-05-27
2,5-二羥甲基-3,6-二甲基吡嗪及其衍
生物
在制藥中的應(yīng)用
【發(fā) 明 人】李偉;陳龍;卞慧敏;文紅梅;劉崢【技術(shù)領(lǐng)域】 本發(fā)明涉及2,5-二羥甲基-3,6-二甲基及其衍生物的應(yīng)用,尤其涉及其在醫(yī)藥領(lǐng)域的用途。【摘要】 2,5-二羥甲基-3,6-二甲基吡嗪及其衍生物在制備治療、預(yù)防心力衰竭疾病藥物中的應(yīng)用。
南京中醫(yī)藥大學(xué)
2021-04-13
一種提高濱海鹽堿地土壤磷素利用效率的
生物
炭肥及其制備方法和施用方法
本發(fā)明提供了一種提高濱海鹽堿地土壤磷素利用效率的生物炭肥及其制備方法和施用方法。其是將木醋與生物炭按照體積/重量比=0.5~2.5ml/1g的比例混合,然后再按照生物炭與硫酸鈣質(zhì)量比5~10:1的比例添加硫酸鈣,混合均勻,得到提高濱海鹽堿地土壤磷素利用效率的生物炭肥。本發(fā)明能夠有效降低鹽堿地土壤pH,降低鹽堿地土壤對農(nóng)作物的傷害,提高土壤磷素的利用效率,不但解決了農(nóng)林廢棄物變廢為寶,且解決了濱海鹽堿地農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中作物抗鹽及其磷肥利用效率的問題,同時(shí)提高鹽堿地高效利用,革新了濱海鹽堿地土壤在農(nóng)業(yè)上的利用途徑。本發(fā)明提供的方法操作簡便、易行,可廣泛用于鹽堿地土壤的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。
青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-13
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