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2020年2月14日，由廈門大學(xué)、深圳市第三人民醫(yī)院和養(yǎng)生堂旗下北京萬泰生物藥業(yè)股份有限公司共同研發(fā)的新冠病毒抗體檢測試劑盒（雙抗原夾心酶聯(lián)免疫法）經(jīng)臨床驗(yàn)證，173名新冠肺炎確診患者中93.1%抗體檢測陽性，而33名健康人中無一陽性，顯示出良好的敏感性和特異性。這是首個(gè)經(jīng)大樣本臨床驗(yàn)證的新冠病毒總抗體檢測試劑。該試劑能同時(shí)檢出包括IgM和IgG在內(nèi)的全部新冠特異性抗體，具有更高的靈敏度，所采用的雙抗原夾心法能夠更好地保障特異性。抗體檢測試劑的另一大突出優(yōu)點(diǎn)是檢測速度快，兩名檢測人員12小時(shí)即可完成1500份標(biāo)本的檢出。由于新冠病毒是首次入侵人類社會，幾乎所有尚未被感染的人的血液中都沒有抗體，只要患者的抗體檢測陽性即可判斷其為新冠病毒的感染者。因此，該總抗體檢測試劑的臨床應(yīng)用，可明顯改善當(dāng)前新冠疫情防控工作中疑似患者核酸檢測速度慢、采樣復(fù)雜、敏感性不高、需要高等級生物安全措施等。

2月21日凌晨，西湖大學(xué)周強(qiáng)研究團(tuán)隊(duì)在論文預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv再次發(fā)文，報(bào)道新冠病毒表面S蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域與細(xì)胞表面受體ACE2全長蛋白（以下簡稱ACE2）的復(fù)合物冷凍電鏡結(jié)構(gòu)，揭開了新冠病毒入侵人體細(xì)胞的神秘面紗。研究發(fā)現(xiàn)，新冠病毒感染人體細(xì)胞的關(guān)鍵在于冠狀病毒的S蛋白與人體ACE2的結(jié)合。準(zhǔn)確地說，是S蛋白“劫持”了原本是控制血壓的ACE2，通過與它的結(jié)合入侵人體。一個(gè)人體細(xì)胞的蛋白，怎么會與病毒發(fā)生聯(lián)系？西湖大學(xué)特聘研究員陶亮用了一個(gè)形象的比喻：“如果把人體想象成一間房屋，把新冠病毒想象成強(qiáng)盜，那么，ACE2就是這間房屋的‘門把手’；S蛋白抓住了它，病毒從而長驅(qū)直入闖進(jìn)人體細(xì)胞。”雖然S蛋白和ACE2是敵我雙方接觸的最前線，但在此次疫情暴發(fā)前，科學(xué)家們從未看清ACE2的全貌及ACE2與新冠病毒S蛋白的相互作用。兩天前，周強(qiáng)實(shí)驗(yàn)室在世界范圍內(nèi)率先報(bào)道了ACE2的高分辨三維空間結(jié)構(gòu)，這一次，他們進(jìn)一步解析出ACE2與新冠病毒S蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域的復(fù)合物結(jié)構(gòu)。

近日，南科大“人流大數(shù)據(jù)和AI驅(qū)動的新型冠狀病毒（COVID-19）傳播建模預(yù)測和模擬推演平臺”內(nèi)測版本正式推出（下簡稱“推演平臺”）。該平臺可實(shí)現(xiàn)在城市尺度上，基于人流移動的新型冠狀病毒傳播感染情況的細(xì)粒度預(yù)測和模擬，為有關(guān)部門制定不同的隔離和公共防疫政策（如封閉特定城市區(qū)域或道路）提供參考。新型冠狀病毒的感染傳播與人流移動存在密不可分的關(guān)聯(lián)。現(xiàn)階段的多數(shù)研究只停留在簡單的相關(guān)性分析以及基于全國地圖的數(shù)據(jù)可視化階段，缺乏在城市尺度上、針對人流移動的細(xì)粒度深度分析，更缺乏基于人流移動的傳播模擬推演模型以及潛在感染源和風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域的挖掘模型。隨著復(fù)工潮的來臨，戰(zhàn)“疫”面臨新的挑戰(zhàn)。南方科技大學(xué)科研部、工學(xué)院、計(jì)算機(jī)科學(xué)與工程系（下簡稱“計(jì)算機(jī)系”）和南方科技大學(xué)-東京大學(xué)超智慧城市聯(lián)合研究中心緊急組織科研力量，成立“新型冠狀病毒傳播建模預(yù)測項(xiàng)目組”，由計(jì)算機(jī)系副教授宋軒擔(dān)任負(fù)責(zé)人，迅速啟動針對新型冠狀病毒傳播感染的“大數(shù)據(jù)分析和AI建模推演平臺”研發(fā)工作。該平臺是一個(gè)針對新型冠狀病毒傳播的大數(shù)據(jù)分析和AI建模平臺（如圖1），其中預(yù)測和模擬推演模型完全由數(shù)據(jù)驅(qū)動，需要使用人流大數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練和優(yōu)化。數(shù)據(jù)擁有單位只要將人流大數(shù)據(jù)輸入平臺，平臺即可以自動完成模型迭代訓(xùn)練，并輸出相關(guān)的預(yù)測和模擬推演的可視化結(jié)果。其預(yù)測和模擬推演的精度由模型訓(xùn)練數(shù)據(jù)的質(zhì)量、精細(xì)度和覆蓋度決定。平臺后續(xù)期待更多單位（如GPS軌跡數(shù)據(jù)、CDR數(shù)據(jù)等人流大數(shù)據(jù)擁有單位）參與進(jìn)來，共同完善該平臺。推演平臺通過整合、處理和分析各類多模態(tài)人流移動和出行大數(shù)據(jù)，結(jié)合新一代的人工智能技術(shù)，完成對新型冠狀病毒的傳播和感染人群細(xì)粒度建模，從而實(shí)現(xiàn)在城市區(qū)域內(nèi)細(xì)粒度預(yù)測、模擬和動態(tài)推演傳播感染情況。平臺可實(shí)現(xiàn)的基本功能主要有以下幾個(gè)方面：一是建立新型冠狀病毒和人流移動的映射模型，包括傳染概率確定/潛伏期分析/傳染代數(shù)分析等；二是分析隱藏病患，由于疾病傳播為鏈?zhǔn)剑梢愿鶕?jù)缺失軌跡鏈反推出尚未確診的疑似病患；三是分析風(fēng)險(xiǎn)人群，可根據(jù)病患軌跡尋找可能有接觸的風(fēng)險(xiǎn)人群，提前預(yù)警；四是挖掘潛在病原地，分析病人間的軌跡交叉點(diǎn)確認(rèn)潛在的未知病原地（如圖3）。在以上功能基礎(chǔ)上，平臺可以實(shí)現(xiàn)設(shè)定不同的公共防疫政策（如封閉城市內(nèi)的高風(fēng)險(xiǎn)感染區(qū)域），在城市尺度上，動態(tài)推演和模擬在這些政策下的城市傳播感染情況，從而幫助相關(guān)部門制定更為高效的隔離和公共防疫政策（如圖4）。

根據(jù)目前的研究，新冠病毒引起的肺炎最常見的癥狀是發(fā)熱和咳嗽等，而表現(xiàn)出腹瀉癥狀的患者較少。廣州中山大學(xué)第三附屬醫(yī)院學(xué)者在預(yù)印本平臺medrxiv發(fā)表文章稱，腹瀉可能是新冠病毒感染的一個(gè)指標(biāo)，提示臨床醫(yī)生應(yīng)更加關(guān)注腹瀉患者。而目前三項(xiàng)研究報(bào)告的腹瀉發(fā)生率不同。作者認(rèn)為，腹瀉可能是一個(gè)被忽視的癥狀。由于冠狀病毒通過結(jié)合ACE2入侵人體細(xì)胞，ACE2也可調(diào)控腸道炎癥，為了追蹤新冠病毒介導(dǎo)的感染途徑，團(tuán)隊(duì)使用單細(xì)胞RNA測序進(jìn)行了分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)， ACE2 在小腸中高度表達(dá)，尤其在近端和遠(yuǎn)端腸細(xì)胞中顯著升高，而ACE2在肺組織中的RNA水平較低。因此，團(tuán)隊(duì)?wèi)岩桑?dāng)人們食用受感染的野生動物時(shí)，表達(dá)ACE2的小腸上皮細(xì)胞可能容易受到新冠病毒感染，腹瀉可能是感染的一個(gè)指標(biāo)。研究還分析了HCOV-229 E病毒的ANPEP受體和Mers-CoV病毒的DPP4受體的表達(dá)譜。發(fā)現(xiàn)這些病毒進(jìn)入受體的 RNA 水平也在近端或遠(yuǎn)端腸細(xì)胞中也呈現(xiàn)高表達(dá)，與ACE2的表達(dá)譜一致。由于ACE2、ANPEP和DPP4的表達(dá)譜明顯重疊，人類腸道很可能是這些病毒的另一種感染途徑。 作者建議，對于新冠病毒感染預(yù)防，不僅要戴好口罩防止通過呼吸道感染，也不能忽視病從口入經(jīng)腸道感染，疫情期間，食物最好要高溫烹飪。由于新冠病毒與SARS病毒高度同源，約20～25%的SARS患者有腹瀉，而目前新冠病毒肺炎的腹瀉發(fā)生率僅2～3%，這令人困惑。作者指出，鑒于疫情中的很多初期患者報(bào)告與野生動物市場有聯(lián)系，這一觀察提出了一個(gè)重要問題，即當(dāng)食物到達(dá)小腸時(shí)，病毒是否通過污染食物傳播。

日前，國防科技大學(xué)系統(tǒng)工程學(xué)院大數(shù)據(jù)與復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)研究團(tuán)隊(duì)同四川大學(xué)、電子科技大學(xué)一起，組建新冠病毒大數(shù)據(jù)交叉學(xué)科研究平臺，助力新型流行病研究和防控，給多個(gè)省份和國家有關(guān)部委等提供了8份數(shù)據(jù)分析報(bào)告和決策建議報(bào)告，為防控和戰(zhàn)勝疫情貢獻(xiàn)出了科學(xué)智慧。國防科技大學(xué)系統(tǒng)工程學(xué)院大數(shù)據(jù)與復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)研究團(tuán)隊(duì)基于新冠病毒大數(shù)據(jù)交叉學(xué)科研究平臺，利用海量多源異構(gòu)大數(shù)據(jù)，結(jié)合疫情發(fā)生發(fā)展規(guī)律，對人群流動及傳播風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行了綜合建模和分析，為政府決策提供了參考依據(jù)。特別是團(tuán)隊(duì)通過分析春運(yùn)期間人口流動大數(shù)據(jù)，建立起疾病傳播模型，測算出了疫情擴(kuò)散蔓延階段武漢市向全國各地區(qū)的輸出人口狀況和新冠病毒感染的風(fēng)險(xiǎn)指數(shù)。還有許多研究人員嘗試通過客運(yùn)數(shù)據(jù)，研判各個(gè)地區(qū)及城市的感染風(fēng)險(xiǎn)。也有學(xué)者采用“百度遷移”所提供的人口流動數(shù)據(jù)，通過春運(yùn)期間從武漢流向全國各省市的人口規(guī)模(不包含港澳臺數(shù)據(jù))和全國感染病毒人數(shù)的可視化分布，直觀解讀兩者間的聯(lián)系。同時(shí)加以推斷，武漢封城之后，二次傳染所造成的病毒傳播將日趨占主導(dǎo)地位，傳播程度和各省市的人口密度以及管控措施等密切相關(guān)。

華中科技大學(xué)同濟(jì)藥學(xué)院李華教授、沈陽藥科大學(xué)無涯創(chuàng)新學(xué)院陳麗霞教授、軍事醫(yī)學(xué)研究院國家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心李行舟研究員等組成聯(lián)合攻關(guān)小組，系統(tǒng)性分析了新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）基因編碼的蛋白作為主要或潛在的藥物治療靶點(diǎn)，并通過計(jì)算機(jī)虛擬篩選方法發(fā)現(xiàn)了一系列具有抗病毒、抗菌和抗炎作用的臨床藥物和天然產(chǎn)物對不同的靶蛋白表現(xiàn)出很高的親和力，為新型冠病毒感染性疾病（COVID-19）的治療提供了新的可能。研究成果在線發(fā)表在SCI雜志《藥學(xué)學(xué)報(bào)》英文版(Acta Pharmaceutica Sinica B,一區(qū)),為了加速新冠病毒藥物研發(fā)，研究組還在文章中公布了所有靶點(diǎn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型和篩選得到的高分潛在藥物供下載，每個(gè)藥物和靶點(diǎn)的共結(jié)構(gòu)可以應(yīng)要求發(fā)送。研究團(tuán)隊(duì)利用生物信息學(xué)和結(jié)構(gòu)基因組學(xué)的方法系統(tǒng)性分析了SARS-CoV-2所有基因編碼的蛋白質(zhì)，并且將基因序列與SARS-CoV和MARS-CoV等冠狀病毒進(jìn)行了比對,通過同源建模的方法構(gòu)建了19個(gè)SARS-CoV-2蛋白和1個(gè)人類宿主的蛋白的同源結(jié)構(gòu)，基本涵蓋了對于冠狀病毒RNA復(fù)制、翻譯；結(jié)構(gòu)組成；入侵宿主細(xì)胞以及干擾宿主固有免疫等至關(guān)重要的所有蛋白靶點(diǎn)，對于進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)特異性靶向SARS-CoV-2的抑制劑提供了理論基礎(chǔ)。研究團(tuán)隊(duì)還構(gòu)建了常用的抗病毒藥物數(shù)據(jù)庫（78個(gè)化合物），包括已經(jīng)上市的、和目前正在進(jìn)行新冠病毒臨床實(shí)驗(yàn)的化合物，把這些化合物和新冠病毒的各個(gè)靶點(diǎn)都進(jìn)行了分子對接，重點(diǎn)分析目前正在進(jìn)行臨床實(shí)驗(yàn)的藥物瑞德西韋、氯喹、克立芝等。目前已知的瑞德西韋抗病毒作用機(jī)制是三磷酸活性代謝產(chǎn)物作為冠狀病毒RNA聚合酶的底物ATP類似物，摻入RNA鏈，從而阻止RNA的合成。研究團(tuán)隊(duì)的對接結(jié)果顯示瑞德西韋和RdRp具有很高親和力，和其目前抗病毒機(jī)制一致。此外，研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)瑞德西韋可能作用于宿主細(xì)胞表面II型跨膜絲氨酸蛋白酶（TMPRSS2），阻止S蛋白被TMPRSS2酶切，從而阻止S蛋白變構(gòu)介導(dǎo)的病毒與細(xì)胞膜融合，可能是瑞德西韋新的作用機(jī)制，這是一個(gè)新方向，為后續(xù)研究提供了思路。

山東大學(xué)藥學(xué)院劉新泳教授團(tuán)隊(duì)與山東省疾控中心聯(lián)合申報(bào)的山東省重大科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目“新型冠狀病毒分離、測序、快速檢測及藥物篩選研究”，獲批經(jīng)費(fèi)450萬元。連日來，該團(tuán)隊(duì)在抗新冠肺炎藥物研究方面取得一系列進(jìn)展。   完成硝唑尼特的原料和制劑工藝研究。劉新泳教授團(tuán)隊(duì)根據(jù)體外抗新型冠狀病毒活性篩選實(shí)驗(yàn)，對已發(fā)現(xiàn)的具有顯著抗新型冠狀病毒作用的上市藥物硝唑尼特（RY2020，原抗寄生蟲藥物），聯(lián)合山東瑞陽制藥進(jìn)行研發(fā)，已完成了藥物合成工藝研究、藥物干混懸劑和片劑的制備工藝、體內(nèi)藥代動力學(xué)的研究。目前正在進(jìn)行抗新型冠狀病毒感染動物藥效學(xué)驗(yàn)證，并擬申報(bào)臨床研究，有望成為本次疫情防控急需的一線藥物。 完成法匹拉韋的產(chǎn)業(yè)化研究。法匹拉韋是抗流感病毒藥物，對新型冠狀病毒肺炎具有較好的臨床治療作用，目前該團(tuán)隊(duì)已完成法匹拉韋合成工藝、產(chǎn)業(yè)化工藝、質(zhì)量控制研究等任務(wù)，正在聯(lián)合山東齊都藥業(yè)申報(bào)國家仿制藥物，用于臨床抗新型冠狀病毒肺炎。 建立基于靶標(biāo)的虛擬篩選平臺。依托山東省藥物分子設(shè)計(jì)與創(chuàng)新藥物研究山東省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，基于新型冠狀病毒的突刺Spike蛋白、蛋白酶PLpro和Mpro、RNA依賴的RNA聚合酶結(jié)構(gòu)，劉新泳教授團(tuán)隊(duì)開展了計(jì)算機(jī)智能化輔助的高通量的藥物虛擬篩選，重點(diǎn)篩選了已上市藥物、商品化分子庫以及課題組自有的多樣性的合成分子庫、天然產(chǎn)物庫、中藥提取物庫，發(fā)現(xiàn)多個(gè)虛擬評價(jià)活性好的臨床已有藥物和實(shí)體小分子化合物。

2020年2月6日，吉林大學(xué)附屬第一醫(yī)院眼科陸成偉團(tuán)隊(duì)在國際頂級醫(yī)學(xué)期刊Lancet 在線發(fā)表題為“2019-nCoV transmission through the ocular surface must not be ignored”的研究，認(rèn)為2019-nCoV通過眼睛的傳播被忽略了。 傳染性飛沫和體液很容易污染人結(jié)膜上皮。呼吸道病毒能夠在感染的患者中引起眼部并發(fā)癥，進(jìn)而導(dǎo)致呼吸道感染。嚴(yán)重的急性呼吸綜合征冠狀病毒（SARS-CoV）主要通過直接或間接傳播（眼睛，嘴或鼻子的粘膜間接接觸）。粘膜裸露和不受保護(hù)的眼睛會增加SARS-CoV傳播的風(fēng)險(xiǎn)，這表明未保護(hù)的眼睛，暴露于2019-nCoV可能會引起急性呼吸道感染。呼吸道可能不是2019-nCoV的唯一傳播途徑，所有檢查可疑病例的眼科醫(yī)生都應(yīng)戴防護(hù)眼鏡。

該研究首次勾勒出新型冠狀病毒復(fù)制機(jī)器的內(nèi)部構(gòu)造，并為瑞德西韋、法匹拉韋等藥物如何精確靶向并抑制病毒復(fù)制提出了合理解釋，這為深入研究新型冠狀病毒遺傳物質(zhì)復(fù)制轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)理奠定了重要基礎(chǔ)，并為開發(fā)抗新冠肺炎的特效藥開辟了新途徑。同樣，團(tuán)隊(duì)在第一時(shí)間公開了研究成果，幫助全球抗病毒藥物研究領(lǐng)域迅速開展工作。同時(shí)，應(yīng)Science期刊編輯的邀請，團(tuán)隊(duì)于3月16日將該工作投送至Science期刊，于4月10日在線發(fā)表。這些成果的迅速獲得，得益于饒子和院士團(tuán)隊(duì)長期、潛心開展冠狀病毒研究的深厚積累。在2003年“非典”爆發(fā)期間，團(tuán)隊(duì)組率先解析出SARS冠狀病毒的第一個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)-主蛋白酶（nsp5）及其與抑制劑復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)，隨后該組又解析出的10多個(gè)主蛋白酶與抑制劑的復(fù)合物結(jié)構(gòu)，為SARS冠狀病毒藥物的研制奠定了關(guān)鍵的生物學(xué)基礎(chǔ)，其中有關(guān)主蛋白酶（nsp5）的研究論文的單篇引用達(dá)347次，抗病毒藥物方面的研究成果獲得國家發(fā)明專利4項(xiàng)。為進(jìn)一步探索冠狀病毒引物酶工作機(jī)制，還相繼解析了SARS冠狀病毒nsp7-8復(fù)合物、復(fù)制校正復(fù)合物nsp14-nsp10、解旋酶nsp13等一系列冠狀病毒轉(zhuǎn)錄復(fù)制核心蛋白的三維結(jié)構(gòu)，為深入理解冠狀病毒生命周期的分子機(jī)制、研發(fā)抗冠狀病毒藥物，提供了關(guān)鍵的科學(xué)基礎(chǔ)。需要指出的是，這些研究成果為發(fā)展抗病毒藥物提供了關(guān)鍵結(jié)構(gòu)生物學(xué)基礎(chǔ)，但是要得到可以實(shí)際使用的藥物，還需要化學(xué)、藥學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)等多領(lǐng)域的科學(xué)家共同努力。