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本發(fā)明公開了一種黃牛TAS1R2基因的單核苷酸多態(tài)性及其檢測方法，其基因單核苷酸多態(tài)性包括：以包含TAS1R2基因的待測黃牛全基因組DNA為模板，以引物對P為引物，PCR擴增黃牛TAS1R2基因；對產(chǎn)物進(jìn)行變性后，再對變性后的擴增片段進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳；根據(jù)電泳結(jié)果鑒定黃牛TAS1R2基因第288bp的堿基多態(tài)性。該方法是一種在DNA水平上篩查和檢測與黃牛產(chǎn)肉性狀密切相關(guān)的分子遺傳標(biāo)記，以用于黃牛的輔助選擇和分子育種，加快黃牛良種繁育速度

南京郵電大學(xué)理學(xué)院曾紅麗副教授與合作者在新型冠狀病毒SARS-CoV-2基因序列分析方面取得重要進(jìn)展，預(yù)測了該病毒在自然選擇過程中的適應(yīng)性，指出并分析了該病毒在演化過程中存在的弱點，分析了相應(yīng)綜合醫(yī)藥開發(fā)應(yīng)注意的關(guān)鍵基因位點。該成果以南京郵電大學(xué)為第一完成單位，于2020年11月17日在線發(fā)表于國際權(quán)威期刊美國國家科學(xué)院院刊（PNAS）上。 COVID-19疫情是由β-冠狀病毒SARS-CoV-2引起的全球性公共衛(wèi)生突發(fā)事件。各類數(shù)據(jù)庫搜集了大量的且不斷增加的高質(zhì)量全基因組序列。本工作利用這些序列，研究其是否顯示出病毒演化過程中上位性對適應(yīng)性的影響。在具有高重組率的種群演化中，本工作創(chuàng)新性地發(fā)展和應(yīng)用了統(tǒng)計物理學(xué)中的反Potts模型，來檢測自然選擇過程中的上位性影響。該工作為利用大量基因組序列來獲取具有高重組率的病原體在演化過程中的弱點開辟了廣闊前景。 該研究工作最終將新型冠狀病毒的大約3萬個基因位點濃縮為存在顯著相互影響的8對基因位點（ORF3a和nsp2，nsp12和nsp6，ORF8和nsp4，以及基因nsp2，nsp13和nsp14），為尋找病毒病原體結(jié)合和重組過程中存在的弱點帶來了希望，對開發(fā)臨床治療的綜合靶向藥物、研究病毒進(jìn)入宿主后的發(fā)病機制有著很強的生物醫(yī)學(xué)指導(dǎo)意義。 和其他許多疾病一樣，針對COVID-19的潛在藥物靶標(biāo)的組合數(shù)量非常多。本研究工作不僅提供了哪些基因位點之間存在相互影響，并可以對其進(jìn)行排名，從而進(jìn)行更進(jìn)一步詳細(xì)研究。結(jié)合隨機性檢驗，該研究工作最終預(yù)測了存在顯著上位性的8對基因位點中，有3對涉及到與新冠肺炎的重癥密切相關(guān)的病毒基因ORF3a。遺憾的是，目前關(guān)于針對ORF3a基因的臨床靶向藥物的報道還較為罕見，值得醫(yī)藥學(xué)研究人員在該方面加強研究。另外，本研究工作中預(yù)測的8對基因位點可作為實驗生物學(xué)的原假設(shè)，以供生物學(xué)研究人員在此基礎(chǔ)上設(shè)置相關(guān)微生物實驗，研究新冠病毒進(jìn)入人體后引起發(fā)病的機理。 此項研究工作由南京郵電大學(xué)與意大利的里雅斯特大學(xué)、古巴哈瓦那大學(xué)、瑞典哥德堡大學(xué)及瑞典皇家理工大學(xué)合作完成。曾紅麗副教授的研究工作受到國家自然科學(xué)基金委（基金號11705097）、江蘇省科學(xué)技術(shù)廳（基金號BK20170895）以及江蘇省政府留學(xué)獎學(xué)金的大力支持。

本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域，特別涉及甘藍(lán)型油菜及其親本物種白菜和甘藍(lán)TT2基因家族及其應(yīng)用； 所述白菜透明種皮2的基因家族包括2個成員：BrTT2-l基因和BrTT2-2基因，所述甘藍(lán)TT2的基因家族的 1個成員BoTT2基因，所述甘藍(lán)型油菜TT2基因家族包括3個成員：BnTT2-l基因、BnTT2-2基因和BnTT2- 3基因；蕓菱屬6個TT2基因之間具有很高的同源性；本發(fā)明還公開了上述基因家族在植物分子育種中的應(yīng) 用,通過反義抑制其在黑籽甘藍(lán)型油菜中的表達(dá)后,轉(zhuǎn)基因植株發(fā)生了種皮顏色變淺等性狀變化，具有創(chuàng)造 轉(zhuǎn)基因黃籽材料的潛力。

本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域，特別涉及甘藍(lán)型油菜及其親本物種白菜和甘藍(lán)MYBL2基因家族及其應(yīng) 用；所述白菜MYBL2基因家族包括2個成員：BrMYBL2-l基因和BrMYBL2-2基因，所述甘藍(lán)MYBL2基因家 族包括2個成員：B0MYBL2-1基因和BoMYBL2-2基因，所述甘藍(lán)型油菜MYBL2基因家族包括4個成員： BnMYBL2-l基因、BnMYBL2-2基因、BnMYBL2-3基因和BnMYBL2-4基因；蕓臺屬8個MYBL2基因之間具 有較高的同源性；本發(fā)明還公開了上述基因家族在植物分子育種中的應(yīng)用，通過構(gòu)建正義超量表達(dá)植物載體，轉(zhuǎn)化黑籽甘藍(lán)型油菜品種中雙10號后，獲得6株轉(zhuǎn)基因植株。與非轉(zhuǎn)基因的外植體對照相比，轉(zhuǎn)基因植 株生長發(fā)育正常，但種皮中原花青素等色素減少，同時種皮變薄，形成轉(zhuǎn)基因黃籽性狀，是油菜黃籽性狀育 種的新資源。

研發(fā)階段/n該發(fā)明涉及人工構(gòu)建的偽狂犬病毒（pseudorabiesvirus，PrV）和豬細(xì)小病毒（porcineparvovirus，PPV）的主要結(jié)構(gòu)基因VP2。在缺失了主要毒力基因（TK）和病毒增殖非必需基因（gG）的偽狂犬病毒基因組中，定位插入豬細(xì)小病毒的VP2基因，使其位于偽狂犬病毒的強晚期啟動子下游，插入的外源基因編碼的蛋白具有良好的免疫原性，可以刺激豬產(chǎn)生抵抗豬細(xì)小病毒和豬偽狂犬病毒兩種強毒攻擊的保護(hù)性免疫反應(yīng)。該發(fā)明還包括重組的偽狂犬病毒Pseudorabiesvirus，Hzau

可以量產(chǎn)/n華雜棉4號是以陸地棉B0011品系為母本，轉(zhuǎn)Bt抗蟲基因陸地棉118-1品系為父本，進(jìn)行人工去雄雜交配制的雜種一代優(yōu)勢組合。2009年通過江西省審定，同時獲得農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物生產(chǎn)應(yīng)用安全證書。產(chǎn)量表現(xiàn)：2006-2007年參加江西省棉花區(qū)域試驗，平均畝產(chǎn)122.3kg/666.7m2。纖維品質(zhì)（HVICC標(biāo)準(zhǔn)）：平均長度29.2mm，整齊度84.8%，比強度30.5cN/tex，伸長率為6.8%，馬克隆值為5.0，反射率為73.1%，黃度為8.6，紡紗均勻性指數(shù)為140.3。枯萎病相對抗指

蝦蟹類基因組是公認(rèn)的高復(fù)雜基因組，要獲得高質(zhì)量的基因組有著很多困難。近日，由鹽城師范學(xué)院江蘇省鹽土生物資源研究重點實驗室教授唐伯平課題組牽頭的中外合作團(tuán)隊，第一次獲得了我國重要淡水和海水經(jīng)濟蟹類中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的高質(zhì)量基因組圖譜，并分別在線發(fā)表于GigaScience和《遺傳學(xué)前沿》。 三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）是我國沿海大型的海洋經(jīng)濟蟹類，我國每年捕撈量在55萬噸左右。唐伯平團(tuán)隊獲得的三疣梭子蟹基因組大小為1.00Gb，片段重疊群N50的長度為 4.12Mb，被注釋到16796個蛋白編碼基因，其基因組的完整性為94.7%，整個基因組的重復(fù)序列是54.52%。科研人員鑒定出三疣梭子蟹染色體為50對，裝配率為97.80%，Hi-C的N50為21.79Mb。這是一個高質(zhì)量、相當(dāng)完整的染色體水平基因組，也是蟹類研究中第一次通過分子生物學(xué)的方法精確地對蟹類染色體數(shù)目進(jìn)行鑒定。 中華絨螯蟹（Eriocheir japonica sinensis）俗稱河蟹，是世界上最重要的淡水經(jīng)濟蟹類，目前我國每年河蟹產(chǎn)量為80萬噸左右。研究人員獲得的中華絨螯蟹基因組大小為1.27Gb，Contig序列N50為3.19Mb，且其GC含量為43%，高于其他節(jié)肢動物。BUSCO評估其完整性為94.00%，重復(fù)序列在基因組中占61.42%，被功能注釋蛋白編碼基因22619個。 唐伯平團(tuán)隊對甲殼動物中華絨螯蟹、三疣梭子蟹、凡納濱對蝦，昆蟲埃及伊蚊、黑腹果蠅、偏瞳蔽眼蝶、蜘蛛等7種節(jié)肢動物基因家系展開進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，它們共有15503個基因家系，其中8832個基因家系為共有家系，328個和544個基因家系分別唯一存在于三疣梭子蟹和中華絨螯蟹中。 在這7種節(jié)肢動物中，蝦蟹相對進(jìn)化速率最小，其中對蝦進(jìn)化速度最慢，其次是絨螯蟹和梭子蟹。“相對于昆蟲，蝦蟹類進(jìn)化較慢，可能是它們生活的環(huán)境相對于昆蟲更加穩(wěn)定。”唐伯平說。 另一個有趣的發(fā)現(xiàn)是，蝦蟹與昆蟲的分化以及螃蟹和對蝦的分化幾乎是同時發(fā)生在4.3億年左右的志留紀(jì)。同屬于短尾類的中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的分化時間則相對較晚，大約是在1.8億年前的侏羅紀(jì)。 我國同時獲得1種海洋和1種淡水重要經(jīng)濟蟹類高質(zhì)量的基因組圖譜，將為蟹類和甲殼動物的研究提供重要的理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐，同時也為經(jīng)濟蟹類育種、養(yǎng)殖和疾病防控工作提供重要的基礎(chǔ)平臺。

牛傳染性鼻氣管炎俗稱紅鼻子病，是由牛皰疹病毒1型（BHV-1）引起的一種牛的急性、熱性、接觸性傳染病，主要引起呼吸道和生殖道疾病。該病的發(fā)生極大地降低了奶牛的產(chǎn)奶量、公牛的繁殖力及役用牛的使役力，并產(chǎn)生呼吸道感染還容易繼發(fā)牛的細(xì)菌性肺炎，疫苗是防制該病的關(guān)鍵。 該項目所用的材料是牛皰疹病毒1型BHV-1臨床分離株，具有全部的毒力因子和其他免疫原性很好的抗原。因此，以該病毒為基礎(chǔ)構(gòu)建的牛傳染性鼻氣管炎ΔTK/ΔgE基因缺失標(biāo)志菌株所制備的基因工程疫苗對牛免疫具有很強的針對性，具有廣闊的市場應(yīng)用前景。 α皰疹病毒成員的主要毒力基因TK基因和牛皰疹病毒1型的十個囊膜糖蛋白之一gE基因的缺失疫苗相較只缺失TK或gE基因的缺失的疫苗更安全可靠，更方便實際操作。 目前國內(nèi)尚無商品化的IBR疫苗和試劑盒上市。該項目通過開展診斷方法研究與疫苗免疫效果評價，制定相對應(yīng)的綜合防控技術(shù)措施，其實用性和可操作性強，有望獲得具有自主知識產(chǎn)權(quán)的基因缺失標(biāo)記疫苗和快速診斷試劑盒，可以保障肉牛業(yè)和奶牛業(yè)的健康發(fā)展，增加農(nóng)民收入，保障畜禽產(chǎn)業(yè)鏈的運行，穩(wěn)定牛肉牛奶供應(yīng)，產(chǎn)生較大的社會經(jīng)濟發(fā)展作用，具有在全國推廣應(yīng)用的價值，推廣前景看好。 轉(zhuǎn)化條件：具有GMP車間，實現(xiàn)規(guī)模化生產(chǎn)。 成果完成時間：2016年

1、 主要解決的技術(shù)問題 該研究通過定向基因缺失技術(shù)將牛傳染性鼻氣管炎病毒的毒力基因TK和必需基因gG缺失，得到了牛傳染性鼻氣管炎的gG和TK雙基因缺失突變株。疫苗免疫是防制牛傳染性鼻氣管炎的根本措施，滅活疫苗不能區(qū)分野毒感染和疫苗免疫牛，弱毒疫苗有殘余毒力和返強風(fēng)險，本研究獲得的牛傳染性鼻氣管炎的gG和TK雙基因缺失突變株，可區(qū)分野毒感染牛和疫苗免疫牛，是血清學(xué)“標(biāo)志”疫苗，為我國牛傳染性鼻氣管炎根除計劃提供了技術(shù)支撐。 2、先進(jìn)性及主要技術(shù)指標(biāo) （1）先進(jìn)性該研究是由我國自主研發(fā)，具有完全知識產(chǎn)權(quán)的牛傳染性鼻氣管炎的gG和TK雙基因缺失突變株。 （2）主要技術(shù)指標(biāo)gG基因缺失，TK基因缺失，接種MDBK細(xì)胞24-48小時可產(chǎn)生細(xì)胞病變，4×105PFU/頭份接種試驗牛即可產(chǎn)生良好的免疫反應(yīng)。 1、市場前景：目前我國尚無自主研發(fā)的、獲批的牛傳染性鼻氣管炎基因標(biāo)記疫苗用于牛傳染性鼻氣管炎的預(yù)防，牛傳染性鼻氣管炎每年給我國的養(yǎng)牛產(chǎn)業(yè)造成巨大的經(jīng)濟損失，市場上急需可以有效防控牛傳染性鼻氣管炎并區(qū)分野毒感染牛和疫苗免疫牛的的疫苗產(chǎn)品，牛鼻氣管炎病毒gG和TK雙基因缺失疫苗的市場前景廣闊。 2、預(yù)期經(jīng)濟效益：銷售成本：18/頭份 銷售價格：30元/頭份 年產(chǎn)值：3000萬元 年利稅：600萬元。 轉(zhuǎn)化條件： 按年產(chǎn)100萬頭份計算，投資總額：1000萬，所需廠房:800-1000平方米，所需人員：15人，主要設(shè)備：GMP車間、懸浮培養(yǎng)生產(chǎn)線、脈動真空高壓滅菌鍋、洗烘聯(lián)動機、分裝扎蓋機、貼簽機等。 成果完成時間：2012年7月