同濟(jì)大學(xué)曹志偉教授團(tuán)隊(duì)與上海市公共衛(wèi)生臨床中心合作,關(guān)于武漢新型冠狀病毒2019-nCoV抗原性計(jì)算的文章(Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus),2020年1月30日在 Journal of Genetics and Genomics在線發(fā)表。
研究表明,S蛋白是冠狀病毒與宿主細(xì)胞表面ACE2受體結(jié)合、進(jìn)而介導(dǎo)病毒入宿主細(xì)胞的關(guān)鍵表面蛋白,是疫苗抗體研發(fā)的重要靶點(diǎn)。基于具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的免疫原性計(jì)算工具CE-Blast,研究小組對(duì)所有冠狀病毒的S蛋白進(jìn)行了系統(tǒng)性的結(jié)構(gòu)模擬和免疫原性掃描,計(jì)算了新病毒與已知17種冠狀病毒亞型之間的免疫原性距離,發(fā)現(xiàn)新病毒S蛋白的免疫原性總體上與SARS更為接近。進(jìn)一步計(jì)算揭示,2019武漢新冠狀病毒與SARS冠狀病毒的S抗原在受體接合區(qū)域(RBD)上存在潛在交叉反應(yīng)表位。
最為重要的是,其中一處與人ACE2受體結(jié)合位點(diǎn)緊密毗鄰。因此,針對(duì)該表位區(qū)域研發(fā)抗體,空間位阻效應(yīng)可能阻斷病毒與ACE2受體的結(jié)合,有望起到病毒感染保護(hù)作用。同時(shí),針對(duì)該表位區(qū)域的SARS抗體,可能對(duì)2019新病毒具有潛在臨床治療價(jià)值。
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