該研究利用兩個不同品系小鼠雜交獲得雜交小鼠,構(gòu)建雜交小鼠父本與母本的Hi-C、ChIP-seq、RNA-seq等組學(xué)數(shù)據(jù)。根據(jù)雜交小鼠的多態(tài)位點(diǎn)和小鼠品系特異基因型把雜交小鼠組學(xué)數(shù)據(jù)分成父本來源基因組和母本來源基因組,這樣就可以在單倍型水平構(gòu)建三維基因組和研究基因調(diào)控。分析表明,同源染色體具有高度相似的相互作用模式,這種相互作用模式的相似性與其等位基因的共表達(dá)水平高度相關(guān)。
未應(yīng)用
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