本發明公開了一種石蒜屬植物外植體的消毒方法,該方法包括:從石蒜屬植物果實中取出種子,將所述種子表面消毒后置于溫水中浸泡,吸脹后取出,再置于升汞中進行渦旋振蕩離心處理,處理完成后漂洗干凈,獲得無菌外植體。本發明將石蒜屬植物種子進行溫水浸泡后,使種子充分吸水吸脹,再置于升汞中進行短時渦旋振蕩,使升汞充分滲入種子中,不僅能夠實現充分殺菌,降低石蒜屬植物種子的污染率,使污染率控制在5.0%左右,而且能夠保持種子的活力,獲得較高的種子萌發率。