本發明涉及細胞工程組織培養技術領域,旨在提供一種有效保存黃菖蒲胚性愈傷組織的方法。該種有效保存黃菖蒲胚性愈傷組織的方法包括步驟:材料采取、愈傷誘導培養、胚性愈傷組織的篩選與保存。本發明以黃菖蒲幼嫩胚為外植體,污染率極低、愈傷誘導率高、愈傷胚性好,繁殖系數高,同時解決了黃菖蒲愈傷組織保存中易褐化和分化等嚴重問題,實用性強,操作簡便,推廣性好。