本實用新型公開了一種帶蓄熱加熱功能的燃料電池熱管理系統,包括小循環水路系統、大循環冷卻系統和去離子水循環系統等水循環系統和以控制器ECU為核心的控制系統。小循環水路系統采用蓄熱器實現對燃料電池的低溫加熱功能,相對于傳統的電加熱器技術,具有控制精度更高、更節能高效的優點。同時,本實用新型采的去離子水循環系統巧妙地將離子交換器設計在大循環水路的除氣管路上面,將系統除氣功能和去離子功能完美的結合起來,有效地避免了現有技術中的高水阻離子交換器對主循環水路的影響。