2020年3月5日,東北師范大學在bioRxiv上上傳了一篇Strong evolutionary convergence of receptor-binding protein spike between COVID-19 and SARS-related coronaviruses的研究,該研究發現SARS-CoV-2和SARS-CoV存在遠緣關系,但兩者都能夠通過同一受體ACE2感染人類宿主,并引起相似的臨床和病理特征,表明S蛋白可能存在趨同進化。然而,其趨同的分子基礎仍不得而知。本研究中使用最近開發的分子植物生態學方法來研究趨同的分子基礎。分析表明,S蛋白在SARS-CoV-2和SARS-CoV相關分支沿線經歷了大量有意義的達爾文選擇。進一步研究顯示,SARS-CoV-2和SARSr-CoV類之間S蛋白的受體結合域(RBD)中趨同進化的氨基酸位點比例異常高,導致RBD序列在系統發生上的聯合。除了S蛋白,作者還發現其伙伴蛋白ORF3a的趨同進化。結果表明,SARS-CoV-2與SARSr-CoV之間具有很強的適應性趨同進化,可能促進它們對類似或相同受體的適應性。最后,作者指出,許多觀察到的蝙蝠SARS-like-CoVs與SARS-CoV-2和SARS-CoV的S蛋白的RBD序列存在趨同進化,可能預先適應人類宿主受體ACE2,因此將是潛在的新的冠狀病毒來源。
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